TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Immobilized pH gradient-driven paper-based IEF: a new method for fractionating complex peptide mixtures before MS analysis"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Critical Care giúp cho các bạn có thêm kiến thức về ngành y học đề tài: Immobilized pH gradient-driven paper-based IEF: a new method for fractionating complex peptide mixtures before MS analysis. | Seshi et al. Clinical Proteomics 2011 8 10 http content 8 1 10 CLINICAL PROTEOMICS RESEARCH Open Access Immobilized pH gradient-driven paper-based IEF a new method for fractionating complex peptide mixtures before MS analysis Beerelli Seshi1 Kumaraguru Raja1 2 and KH Chandramouli1 3 Correspondence BSeshi@ department of Pathology and Laboratory Medicine Los Angeles Biomedical Research Institute at Harbor-UCLA Medical Center 1124 West Carson Street Torrance California 90502 USA Full list of author information is available at the end of the article 2 BioMed Central Abstract Introduction The vast difference in the abundance of different proteins in biological samples limits the determination of the complete proteome of a cell type requiring fractionation of proteins and peptides before MS analysis. Methods We present a method consisting of electrophoresis of complex mixtures of peptides using a strip of filter paper cut into 20 sections laid end to end over a 24-cm-long IPG strip the pH gradient of which would drive the electrophoresis. Peptides absorbed onto individual paper pads after electrophoresis are subsequently recovered into a buffer solution thus dividing a complex peptide mixture according to pI into 20 liquid fractions. This paper-based IEF method PIEF was compared side-by-side with a similar but liquid-based Offgel electrophoresis OGE by analyzing iTRAQ-labeled peptide mixtures of membrane proteins from four different cell types. Results PIEF outperformed OGE in resolving acidic peptides whereas OGE did a better job in recovering relatively basic peptides. OGE and PIEF were quite comparable in their coverage identifying almost equal number of distinct proteins PIEF 1174 OGE 1080 . Interestingly however only 675 were identified by both of them each method identifying many unique proteins PIEF 499 OGE 415 . Thus the two methods uncovered almost 40 more proteins compared to what is obtained by only one method. .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.