TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " support for multiple classes of local expression clusters in Drosophila melanogaster, but no evidence for gene order conservation"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: support for multiple classes of local expression clusters in Drosophila melanogaster, but no evidence for gene order conservation. | Weber and Hurst Genome Biology 2011 12 R23 http 2011 12 3 R23 Genome Biology RESEARCH Open Access Support for multiple classes of local expression clusters in Drosophila melanogaster but no evidence for gene order conservation Claudia C Weber and Laurence D Hurst Abstract Background Gene order in eukaryotic genomes is not random with genes with similar expression profiles tending to cluster. In yeasts the model taxon for gene order analysis such syntenic clusters of non-homologous genes tend to be conserved over evolutionary time. Whether similar clusters show gene order conservation in other lineages is however undecided. Here we examine this issue in Drosophila melanogaster using high-resolution chromosome rearrangement data. Results We show that D. melanogaster has at least three classes of expression clusters first as observed in mammals large clusters of functionally unrelated housekeeping genes second small clusters of functionally related highly co-expressed genes and finally as previously defined by Spellman and Rubin larger domains of coexpressed but functionally unrelated genes. The latter are however not independent of the small co-expression clusters and likely reflect a methodological artifact. While the small co-expression and housekeeping essential gene clusters resemble those observed in yeast in contrast to yeast we see no evidence that any of the three cluster types are preserved as synteny blocks. If anything adjacent co-expressed genes are more likely to become rearranged than expected. Again in contrast to yeast in D. melanogaster gene pairs with short intergene distance or in divergent orientations tend to have higher rearrangement rates. These findings are consistent with coexpression being partly due to shared chromatin environment. Conclusions We conclude that while similar in terms of cluster types gene order evolution has strikingly different patterns in yeasts and in D. melanogaster although recombination is associated

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.