TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "The NFI-Regulome Database: A tool for annotation and analysis of control regions of genes regulated by Nuclear Factor I transcription factors"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: The NFI-Regulome Database: A tool for annotation and analysis of control regions of genes regulated by Nuclear Factor I transcription factors. | Gronostajski et al. Journal of Clinical Bioinformatics 2011 1 4 http content 1 1 4 JOURNAL OF CLINICAL BIOINFORMATICS DATABASE Open Access The NFI-Regulome Database A tool for annotation and analysis of control regions of genes regulated by Nuclear Factor I transcription factors Richard M Gronostajski1 2 Joseph Guaneri2 3 Dong Hyun Lee4 Steven M Gallo5 Abstract Background Genome annotation plays an essential role in the interpretation and use of genome sequence information. While great strides have been made in the annotation of coding regions of genes less success has been achieved in the annotation of the regulatory regions of genes including promoters enhancers silencers and other regulatory elements. One reason for this disparity in annotated information is that coding regions can be assessed using high-throughput techniques such as EST sequencing while annotation of regulatory regions often requires a gene-by-gene approach. Results The NFI-Regulome database http was designed to promote easy annotation of the regulatory regions of genes that contain binding sites for the NFI Nuclear Factor I family of transcription factors using data from the published literature. Binding sites are annotated together with the sequence of the gene obtained from the UCSC Genome site and the locations of all binding sites for multiple genes can be displayed in a number of formats designed to facilitate inter-gene comparisons. Classes of genes based on expression pattern disease involvement or types of binding sites present can be readily compared in order to assess common architectural structures in the regulatory regions. Conclusions The NFI-Regulome database allows rapid display of the relative locations and number of transcription factor binding sites of individual or defined sets of genes that contain binding sites for NFI transcription factors. This database may in the future be expanded into a distributed database .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.