TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Targeted enrichment beyond the consensus coding DNA sequence exome reveals exons with higher variant densities"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Targeted enrichment beyond the consensus coding DNA sequence exome reveals exons with higher variant densities. | Bainbridge et al. Genome Biology 2011 12 R68 http 2011 12 7 R68 Genome Biology RESEARCH Open Access Targeted enrichment beyond the consensus coding DNA sequence exome reveals exons with higher variant densities 1 1 1 1 3 Matthew N Bainbridge Min Wang Yuanqing Wu Irene Newsham Donna M Muzny John L Jefferies Thomas J Albert4 Daniel L Burgess4 and Richard A Gibbs 1 Abstract Background Enrichment of loci by DNA hybridization-capture followed by high-throughput sequencing is an important tool in modern genetics. Currently the most common targets for enrichment are the protein coding exons represented by the consensus coding DNA sequence CCDS . The CCDS however excludes many actual or computationally predicted coding exons present in other databases such as RefSeq and Vega and non-coding functional elements such as untranslated and regulatory regions. The number of variants per base pair variant density and our ability to interrogate regions outside of the CCDS regions is consequently less well understood. Results We examine capture sequence data from outside of the CCDS regions and find that extremes of GC content that are present in different subregions of the genome can reduce the local capture sequence coverage to less than 50 relative to the CCDS. This effect is due to biases inherent in both the Illumina and SOLiD sequencing platforms that are exacerbated by the capture process. Interestingly for two subregion types microRNA and predicted exons the capture process yields higher than expected coverage when compared to whole genome sequencing. Lastly we examine the variation present in non-CCDS regions and find that predicted exons as well as exonic regions specific to RefSeq and Vega show much higher variant densities than the CCDS. Conclusions We show that regions outside of the CCDS perform less efficiently in capture sequence experiments. Further we show that the variant density in computationally predicted exons is more than .

• Báo cáo khoa học
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• kiến thức y học
• nghiên cứu y học
• CÁCH TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• PHƯƠNG PHÁP TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• KĨ NĂNG TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• MẸO TRÌNH BÁY BÁO CÁO
• TRÌNH BÀY BÁO CÁO KHOA HỌC
• TRÌNH BÀY LUẬN VĂN BÁO CÁO
• Hình thức báo cáo thực tập
• Báo cáo thực tập tốt nghiệp
• Báo cáo thực tập
• Trình bày báo cáo thực tập
• Hướng dẫn trình bày báo cáo
• Hướng dẫn viết báo cáo
• Mẫu báo cáo
• Cách trình bày luận văn
• Cách trình bày khóa luận
• Thể thức của báo cáo
• trình bày luận văn
• báo cáo nông nghiệp
• báo cáo y dược
• báo cáo sinh học
• chăn nuôi lợn
• Kỹ năng trình bày báo cáo
• Kỹ năng thuyết trình
• Thiết kế slide
• Định dạng văn bản
• Nội dung trình bày báo cáo
• Thời gian thuyết trình
• Thực tập chuyên ngành
• Hướng dẫn viết tiểu luận
• Cấu trúc báo cáo
• Cách thể hiện báo cáo
• Nội dung báo cáo
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• tài liệu báo cáo nghiện cứu khoa học
• báo cáo ngành văn học
• báo cáo tiếng anh
• báo cáo khoa học
• thơ lục bát
• chăn nuôi
• báo cáo ngành kỹ thuật
• báo cáo ngành nông nghiệp
• báo cáo ngành ngoại ngữ
• báo cáo kinh tế
• báo cáo ngành tin học
• tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học
• báo cáo ngành y học
• trình bày thông tin tài sản thiếu trong báo cáo tài chính
• trình bày thông tin tài sản
• trình bày thông tin tài sản trong báo cáo tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính
• tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính doanh nghiệp
• báo cáo tài chính
• Tài liệu về trình bày đồ án
• Trình bày đồ án tốt nghiệp
• Quy định trình bày báo cáo cáo chuyên đề
• Quy định trình bày bài tập lớn
• Viện Đại học Mở Hà Nội
• mẫu báo cáo thực tập tốt nghiệp
• trình bày luận án
• cách viết báo cáo tốt nghiệp
• báo cáo tốt nghiệp
• Báo cáo phân tích ngành hàng hải
• báo cáo khoa học kinh tế
• báo cáo kỹ thuật