TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Methods for analyzing deep sequencing expression data: constructing the human and mouse promoterome with deepCAGE data"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Minireview cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Methods for analyzing deep sequencing expression data: constructing the human and mouse promoterome with deepCAGE data. | Open Access Methods for analyzing deep sequencing expression data constructing the human and mouse promoterome with deepCAGE data Piotr J Balwierz Piero Carninci Carsten O Daub Jun Kawai Yoshihide Hayashizaki Werner Van Belle Christian Beisel and Erik van Nimwegen Addresses Biozentrum University of Basel and Swiss Institute of Bioinformatics Klingelbergstrasse 50 70 4056-CH Basel Switzerland. tRIKEN Omics Science Center RIKEN Yokohama Institute 1-7-22 Suehiro-cho Tsurumi-ku Yokohama Kanagawa 230-0045 Japan. laboratory of Quantitative Genomics Department of Biosystems Science and Engineering Eidgenossische Technische Hochschule Zurich Mattenstrasse 26 4058 Basel Switzerland. Correspondence Erik van Nimwegen. Email Published 22 July 2009 Genome Biology 2009 10 R79 doi gb-2009- 10-7-r79 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2009 10 7 R79 Received 23 October 2008 Revised 2 March 2009 Accepted 22 July 2009 2009 Balwierz et al. licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract With the advent of ultra high-throughput sequencing technologies increasingly researchers are turning to deep sequencing for gene expression studies. Here we present a set of rigorous methods for normalization quantification of noise and co-expression analysis of deep sequencing data. Using these methods on 122 cap analysis of gene expression CAGE samples of transcription start sites we construct genome-wide promoteromes in human and mouse consisting of a three-tiered hierarchy of transcription start sites transcription start clusters and transcription start regions. Background In recent years several technologies have become available that allow

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.