TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Differential expression analysis for sequence count data"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Differential expression analysis for sequence count data. | Anders and Huber Genome Biology 2010 11 R106 http 2010 11 10 R106 Genome Biology METHOD Open Access Differential expression analysis for sequence count data Simon Anders Wolfgang Huber Abstract High-throughput sequencing assays such as RNA-Seq ChIP-Seq or barcode counting provide quantitative readouts in the form of count data. To infer differential signal in such data correctly and with good statistical power estimation of data variability throughout the dynamic range and a suitable error model are required. We propose a method based on the negative binomial distribution with variance and mean linked by local regression and present an implementation DESeq as an R Bioconductor package. Background High-throughput sequencing of DNA fragments is used in a range of quantitative assays. A common feature between these assays is that they sequence large amounts of DNA fragments that reflect for example a biological system s repertoire of RNA molecules RNA-Seq 1 2 or the DNA or RNA interaction regions of nucleotide binding molecules ChIP-Seq 3 HITS-CLIP 4 . Typically these reads are assigned to a class based on their mapping to a common region of the target genome where each class represents a target transcript in the case of RNA-Seq or a binding region in the case of ChIP-Seq. An important summary statistic is the number of reads in a class for RNA-Seq this read count has been found to be to good approximation linearly related to the abundance of the target transcript 2 . Interest lies in comparing read counts between different biological conditions. In the simplest case the comparison is done separately class by class. We will use the term gene synonymously to class even though a class may also refer to for example a transcription factor binding site or even a barcode 5 . We would like to use statistical testing to decide whether for a given gene an observed difference in read counts is significant that is whether it is greater than what would be .

• Báo cáo khoa học
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• kiến thức y học
• nghiên cứu y học
• CÁCH TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• PHƯƠNG PHÁP TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• KĨ NĂNG TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• MẸO TRÌNH BÁY BÁO CÁO
• TRÌNH BÀY BÁO CÁO KHOA HỌC
• TRÌNH BÀY LUẬN VĂN BÁO CÁO
• Hình thức báo cáo thực tập
• Báo cáo thực tập tốt nghiệp
• Báo cáo thực tập
• Trình bày báo cáo thực tập
• Hướng dẫn trình bày báo cáo
• Hướng dẫn viết báo cáo
• Mẫu báo cáo
• Cách trình bày luận văn
• Cách trình bày khóa luận
• Thể thức của báo cáo
• trình bày luận văn
• báo cáo nông nghiệp
• báo cáo y dược
• báo cáo sinh học
• chăn nuôi lợn
• Kỹ năng trình bày báo cáo
• Kỹ năng thuyết trình
• Thiết kế slide
• Định dạng văn bản
• Nội dung trình bày báo cáo
• Thời gian thuyết trình
• Thực tập chuyên ngành
• Hướng dẫn viết tiểu luận
• Cấu trúc báo cáo
• Cách thể hiện báo cáo
• Nội dung báo cáo
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• tài liệu báo cáo nghiện cứu khoa học
• báo cáo ngành văn học
• báo cáo tiếng anh
• báo cáo khoa học
• thơ lục bát
• chăn nuôi
• báo cáo ngành kỹ thuật
• báo cáo ngành nông nghiệp
• báo cáo ngành ngoại ngữ
• báo cáo kinh tế
• báo cáo ngành tin học
• tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học
• báo cáo ngành y học
• trình bày thông tin tài sản thiếu trong báo cáo tài chính
• trình bày thông tin tài sản
• trình bày thông tin tài sản trong báo cáo tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính
• tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính doanh nghiệp
• báo cáo tài chính
• Tài liệu về trình bày đồ án
• Trình bày đồ án tốt nghiệp
• Quy định trình bày báo cáo cáo chuyên đề
• Quy định trình bày bài tập lớn
• Viện Đại học Mở Hà Nội
• mẫu báo cáo thực tập tốt nghiệp
• trình bày luận án
• cách viết báo cáo tốt nghiệp
• báo cáo tốt nghiệp
• Báo cáo phân tích ngành hàng hải
• báo cáo khoa học kinh tế
• báo cáo kỹ thuật