TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Design and evaluation of genome-wide libraries for RNA interference screens"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Design and evaluation of genome-wide libraries for RNA interference screens. | Horn et al. Genome Biology 2010 11 R61 http 2010 11 6 R61 w Genome Biology SOFTWARE Open Access Design and evaluation of genome-wide libraries for RNA interference screens Thomas Horn 1 2 Thomas Sandmann1 3 and Michael Boutros 1 Abstract RNA interference RNAi screens have enabled the systematic analysis of many biological processes in cultured cells and whole organisms. The success of such screens and the interpretation of the data depend on the stringent design of RNAi libraries. We describe and validate NEXT-RNAi a software for the automated design and evaluation of RNAi sequences on a genome-wide scale. NEXT-RNAi is implemented as open-source software and is accessible at http . Rationale RNA interference RNAi screens have become an important tool for the identification and characterization of gene function on a large-scale and complement classic mutagenesis screens by providing a means to target almost every transcript in a sequenced and annotated genome. RNAi is a post-transcriptional gene silencing mechanism conserved from plants to humans and relies on the delivery of exogenous short double-stranded RNAs dsRNAs that trigger the degradation of homologous mRNAs in cells 1 2 . As an experimental tool RNAi is now widely used to silence the expression of genes in a broad spectrum of organisms 3 . The availability of genome-wide RNAi libraries for cellbased assays and whole organisms has opened new avenues to query genomes for a broad spectrum of loss-of-function phenotypes 4 5 . The number of sequenced genomes is steadily rising enabling reverse genetic approaches using RNAi in many novel model systems including for example the medically relevant vector Anopheles gambiae and species used to study evolutionary aspects of development such as Tribolium casta-neum Acyrthosiphon pisum and Schmidtea mediterranea. RNAi libraries will facilitate the functional characterization of genes in these species either through Correspondence .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.