TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Molecular profile and copy number analysis of sporadic colorectal cancer in Taiwan"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học quốc tế cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Molecular profile and copy number analysis of sporadic colorectal cancer in Taiwan | Lin et al. Journal of Biomedical Science 2011 18 36 http content 18 1 36 BIN sc The cost of publication in Journal of Biomedical Science Is borne by the National Science Council Taiwan JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE RESEARCH Open Access Molecular profile and copy number analysis of sporadic colorectal cancer in Taiwan 1 f 2f 2f 1 2 3 Chien-Hsing Lin Jen-Kou Lin Shih-Ching Chang Ya-Hui Chang Hwey-May Chang Jin-Hwang Liu Ling-Hui Li4 Yuan-Tsong Chen4 Shih-Feng Tsai1 5 and Wei-Shone Chen 2 Abstract Background Colorectal cancer CRC is a major health concern worldwide and recently becomes the most common cancer in Asia. The case collection of this study is one of the largest sets of CRC in Asia and serves as representative data for investigating genomic differences between ethnic populations. We took comprehensive and high-resolution approaches to compare the clinicopathologic and genomic profiles of microsatellite instability MSI vs. microsatellite stability MSS in Taiwanese sporadic CRCs. Methods 1 173 CRC tumors were collected from the Taiwan population and sequencing-based microsatellite typing assay was used to determine MSI and MSS. Genome-wide SNP array was used to detect CN alterations in 16 MSI-H and 13 MSS CRCs and CN variations in 424 general controls. Gene expression array was used to evaluate the effects of CN alterations and quantitative PCR methods were used to replicate the findings in independent clinical samples. Results These 1 173 CRC tumors can be classified into 75 high-frequency MSI MSI-H 96 low-frequency MSI and 1 002 MSS . Of the 75 MSI-H tumors 22 had a BRAF mutation and 51 showed MLH1 promoter hypermethylation. There were distinctive differences in the extent of CN alterations between CRC MSS and MSI-H subtypes 300 Mb vs. 42 Mb per genome p-value . Also chr7 8q 13 and 20 gains and 8p and 18 losses were frequently found in MSS but not in MSI-H. Nearly a quarter of CN alterations were smaller than 100 kb .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.