TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Distinct patterns of SSR distribution in the Arabidopsis thaliana and rice genomes"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Minireview cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Distinct patterns of SSR distribution in the Arabidopsis thaliana and rice genomes. | Research Open Access Distinct patterns of SSR distribution in the Arabidopsis thaliana and rice genomes Mark J Lawson and Liqing Zhang Address Department of Computer Science Virginia Tech 655 McBryde Blacksburg VA 24060 USA. Correspondence LiqingZhang. Email lqzhang@ Published 21 February 2006 Genome Biology 2006 7 RI4 doi I86 gb-2006-7-2-rI4 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2006 7 2 RI4 Received 26 August 2005 Revised 26 October 2005 Accepted 30 January 2006 2006 Lawson and Zhang licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract Background Simple sequence repeats SSRs in DNA have been traditionally thought of as functionally unimportant and have been studied mainly as genetic markers. A recent handful of studies have shown however that SSRs in different positions of a gene can play important roles in determining protein function genetic development and regulation of gene expression. We have performed a detailed comparative study of the distribution of SSRs in the sequenced genomes of Arabidopsis thaliana and rice. Results SSRs in different genic regions - 5 untranslated region UTR 3 UTR exon and intron -show distinct patterns of distribution both within and between the two genomes. Especially notable is the much higher density of SSRs in 5 UTRs compared to the other regions and a strong affinity towards trinucleotide repeats in these regions for both rice and Arabidopsis. On a genomic level mononucleotide repeats are the most prevalent type of SSRs in Arabidopsis and trinucleotide repeats are the most prevalent type in rice. Both plants have the same most common mononucleotide A T and dinucleotide AT and AG repeats but have little

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.