Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo khoa học: DG-based prediction and experimental confirmation of SYCRP1-binding sites on the Synechocystis genome
TAILIEUCHUNG - Báo cáo khoa học: DG-based prediction and experimental confirmation of SYCRP1-binding sites on the Synechocystis genome
DNA-binding sites for SYCRP1, which is a regulatory protein of the cyanobacterium Synechocystissp. PCC6803, were predicted for the whole genome sequence by estimating changes in the binding free energy (DDG A total ) for SYCRP1 for those sites. The DDG A total values were calculated by summingDDGvalues derived from systematic single base-pair substitu-tion experiments (symmetrical and cooperative binding model). | ễFEBS Journal DG-based prediction and experimental confirmation of SYCRPI-binding sites on the Synechocystis genome Katsumi Omagari1 Hidehisa Yoshimura2 Takayuki Suzuki2 Mitunori Takano3 Masayuki Ohmori2 4 and Akinori Sarai5 1 Department of Virology MedicalSchool Nagoya City University Japan 2 Department of Life Sciences Graduate Schoolof Arts and Sciences The University of Tokyo Japan 3 Department of Physics Schoolof Science and Engineering Waseda University Tokyo Japan 4 Department of BiologicalSciences Faculty of Science and Engineering Chuo University Tokyo Japan 5 Department of BiochemicalEngineering and Science Kyushu Institute of Technology KIT Fukuoka Japan Keywords additivity binding free energy change DNA-binding sites prediction regulatory protein Correspondence K. Omagari Department of Virology Medical School Nagoya City University 1 Kawasumi Mizuho Nagoya 467-8601 Japan Tel Fax 81 52 853 8191 3638 E-mail usagi525@ Received 13 April2008 revised 21 June 2008 accepted 30 July 2008 doi DNA-binding sites for SYCRP1 which is a regulatory protein of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC6803 were predicted for the whole genome sequence by estimating changes in the binding free energy AAG l for SYCRP1 for those sites. The AAGtotal values were calculated by summing AAG values derived from systematic single base-pair substitution experiments symmetrical and cooperative binding model . Of the calculated binding sites 23 sites with a AAGtotalvalue kcal-mol-1 located upstream or between the ORFs were selected as putative binding sites for SYCRP1. In order to confirm whether SYCRP1 actually binds to these binding sites or not 11 sites with the lowest AAGtotal values were tested experimentally and we confirmed that SYCRP1 binds to ten of the 11 sites with a AAGtotai value kcal-mol-1. The best correlation coefficient between AAGtotal and the observed DDGtotal for binding of SYCRP1 to those sites was . .
Gia Uy
40
10
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học: From functional genomics to systems biology Meeting report based on the presentations at the 3rd EMBL Biennial Symposium 2006 (Heidelberg, Germany) Sergii Ivakhno
10
85
0
Báo cáo khoa học: It is all about resolution Meeting report based upon presentations at the 10th International Global BioMillennium 2006 symposium on molecular cell biology (Tbilisi, Georgia)
4
60
0
Báo cáo khoa học: Serpins 2005 – fun between theb-sheets Meeting report based upon presentations made at the 4th Interna-tional Symposium on Serpin Structure, Function and Biology (Cairns, Australia)
6
59
0
Báo cáo khoa học: Acetylcholinesterase in cell adhesion, neurite growth and network formation
7
91
0
Báo cáo khoa học: Characterization of Mycobacterium tuberculosis nicotinamidase/pyrazinamidase
10
62
0
Báo cáo khoa học: The relative contribution of mannose salvage pathways to glycosylation in PMI-deficient mouse embryonic fibroblast cells
11
54
0
Báo cáo khoa học: Schizosaccharomyces pombe positive cofactor 4 stimulates basal transcription from TATA-containing and TATA-less promoters through Mediator and transcription factor IIA
11
88
0
Báo cáo khoa học về: INVITED LECTURES
61
85
0
Báo cáo khoa học: Intermittent hypoxia is a key regulator of cancer cell and endothelial cell interplay in tumours
12
86
0
Báo cáo khoa học: Hexameric ring structure of the N-terminal domain of Mycobacterium tuberculosis DnaB helicase
8
85
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461867
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22643
59
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10892
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10066
446
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9519
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8281
1125
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8238
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7864
2220
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6687
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5770
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Report medicine
traditional medicine
scientific reports
oxidation
Crystal structure
bacteria
medical knowledge
medical research
analysis of cytoplasmic
hemoglobin
medicine
cell proliferation
breast cancer
chemical reaction
gastric cancer
hormone medicine
tumor cells
biochemical studies
environmental medicine
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Báo cáo khoa học: Loss of kinase activity in Mycobacterium tuberculosis multidomain protein Rv1364c
14
235
0
27-04-2024
Oreilly learning the vi Editor phần 4
19
229
0
27-04-2024
BeginningMac OS X Tiger Dashboard Widget Development 2006 phần 2
34
212
0
27-04-2024
beginning Ubuntu Linux phần 1
34
212
1
27-04-2024
Bơm máy nén quạt trong công nghiệp part 8
20
198
2
27-04-2024
MySQL Basics for Visual Learners PHẦN 9
15
184
0
27-04-2024
MySQL Database Usage & Administration PHẦN 7
37
156
0
27-04-2024
THE ANTHROPOLOGY OF ONLINE COMMUNITIES BY Samuel M.Wilson and Leighton C. Peterson
19
145
0
27-04-2024
B2B Content Marketing: 2012 Benchmarks, Budgets & Trends
17
138
0
27-04-2024
Giáo trình CẤU TRÚC DỮ LIỆU VÀ GIẢI THUẬT - Chương 1
5
126
0
27-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7864
2220
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5737
1368
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3767
1231
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5319
1136
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8281
1125
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3499
643
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10892
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3684
525
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4046
515
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4128
480
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.