TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Identification of fusion genes in breast cancer by paired-end RNA-sequencing"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Identification of fusion genes in breast cancer by paired-end RNA-sequencing. | Edgren et al. Genome Biology 2011 12 R6 http 2011 12 1 R6 Genome Biology RESEARCH Open Access Identification of fusion genes in breast eaneer by paired-end RNA-sequeneing 1 f 1 f 1 f 1 2 23 Henrik Edgren Astrid Murumagi Sara Kangaspeska Daniel Nicorici Vesa Hongisto Kristine Kleivi 3 2 1 14 1 Inga H Rye Sandra Nyberg Maija Wolf Anne-Lise Borresen-Dale Olli Kallioniemi Abstract Background Until recently chromosomal translocations and fusion genes have been an underappreciated class of mutations in solid tumors. Next-generation sequencing technologies provide an opportunity for systematic characterization of cancer cell transcriptomes including the discovery of expressed fusion genes resulting from underlying genomic rearrangements. Results We applied paired-end RNA-seq to identify 24 novel and 3 previously known fusion genes in breast cancer cells. Supported by an improved bioinformatic approach we had a 95 success rate of validating gene fusions initially detected by RNA-seq. Fusion partner genes were found to contribute promoters 5 UTR coding sequences and 3 UTRs. Most fusion genes were associated with copy number transitions and were particularly common in high-level DNA amplifications. This suggests that fusion events may contribute to the selective advantage provided by DNA amplifications and deletions. Some of the fusion partner genes such as GSDMB in the TATDN1-GSDMB fusion and IKZF3 in the VAPB-IKZF3 fusion were only detected as a fusion transcript indicating activation of a dormant gene by the fusion event. A number of fusion gene partners have either been previously observed in oncogenic gene fusions mostly in leukemias or otherwise reported to be oncogenic. RNA interference-mediated knock-down of the VAPB-IKZF3 fusion gene indicated that it may be necessary for cancer cell growth and survival. Conclusions In summary using RNA-sequencing and improved bioinformatic stratification we have discovered a number of novel fusion genes in breast

• Báo cáo khoa học
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• kiến thức y học
• nghiên cứu y học
• CÁCH TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• PHƯƠNG PHÁP TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• KĨ NĂNG TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• MẸO TRÌNH BÁY BÁO CÁO
• TRÌNH BÀY BÁO CÁO KHOA HỌC
• TRÌNH BÀY LUẬN VĂN BÁO CÁO
• Hình thức báo cáo thực tập
• Báo cáo thực tập tốt nghiệp
• Báo cáo thực tập
• Trình bày báo cáo thực tập
• Hướng dẫn trình bày báo cáo
• Hướng dẫn viết báo cáo
• Mẫu báo cáo
• Cách trình bày luận văn
• Cách trình bày khóa luận
• Thể thức của báo cáo
• trình bày luận văn
• báo cáo nông nghiệp
• báo cáo y dược
• báo cáo sinh học
• chăn nuôi lợn
• Kỹ năng trình bày báo cáo
• Kỹ năng thuyết trình
• Thiết kế slide
• Định dạng văn bản
• Nội dung trình bày báo cáo
• Thời gian thuyết trình
• Thực tập chuyên ngành
• Hướng dẫn viết tiểu luận
• Cấu trúc báo cáo
• Cách thể hiện báo cáo
• Nội dung báo cáo
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• tài liệu báo cáo nghiện cứu khoa học
• báo cáo ngành văn học
• báo cáo tiếng anh
• báo cáo khoa học
• thơ lục bát
• chăn nuôi
• báo cáo ngành kỹ thuật
• báo cáo ngành nông nghiệp
• báo cáo ngành ngoại ngữ
• báo cáo kinh tế
• báo cáo ngành tin học
• tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học
• báo cáo ngành y học
• trình bày thông tin tài sản thiếu trong báo cáo tài chính
• trình bày thông tin tài sản
• trình bày thông tin tài sản trong báo cáo tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính
• tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính doanh nghiệp
• báo cáo tài chính
• Tài liệu về trình bày đồ án
• Trình bày đồ án tốt nghiệp
• Quy định trình bày báo cáo cáo chuyên đề
• Quy định trình bày bài tập lớn
• Viện Đại học Mở Hà Nội
• mẫu báo cáo thực tập tốt nghiệp
• trình bày luận án
• cách viết báo cáo tốt nghiệp
• báo cáo tốt nghiệp
• Báo cáo phân tích ngành hàng hải
• báo cáo khoa học kinh tế
• báo cáo kỹ thuật