TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "The CRIT framework for identifying cross patterns in systems biology and application to chemogenomics"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: The CRIT framework for identifying cross patterns in systems biology and application to chemogenomics. | Gianoulis et al. Genome Biology 2011 12 R32 http 2011 12 3 R32 Genome Biology METHOD Open Access The CRIT framework for identifying cross patterns in systems biology and application to ehemogenomies Tara A Gianoulis1 2 Ashish Agarwal3 4 Michael Snyder5 and Mark B Gerstein3 4 6 Abstract Biological data is often tabular but finding statistically valid connections between entities in a sequence of tables can be problematic - for example connecting particular entities in a drug property table to gene properties in a second table using a third table associating genes with drugs. Here we present an approach CRIT to find connections such as these and show how it can be applied in a variety of genomic contexts including chemogenomics data. Background Understanding the relationship between two or more variables is a driving motivation of many biological questions. The past several decades has seen a rapid increase in our ability to discern such relationships at multiple levels from molecular to cellular to whole populations. However our ability to understand the relationships between different scales and different types of data is still limited 1 . Here we introduce Cross Pattern Identification Technique CRIT as a means of integrating at least three matrices which do not all share the same index. The goal of CRIT is to systematically combine information from multiple tables with different indices allowing one to not only stack features in a single dimension but also to span across multiple ones. Thus CRIT captures a new type of relationship between different types of data for example drugs and their protein targets which we term a cross pattern. What is a cross pattern and how does this differ from the more traditional integration methods There are two main differences 1 It preserves the underlying structure of the individual datasets allowing for greater transparency and more importantly 2 it does not rely on a single index for querying. In other words .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.