TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Research Article Inference of Gene Regulatory Networks Based on a Universal Minimum Description Length"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành hóa học dành cho các bạn yêu hóa học tham khảo đề tài: Research Article Inference of Gene Regulatory Networks Based on a Universal Minimum Description Length | Hindawi Publishing Corporation EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology Volume 2008 Article ID 482090 11 pages doi 2008 482090 Research Article Inference of Gene Regulatory Networks Based on a Universal Minimum Description Length John Dougherty Ioan Tabus and Jaakko Astola Institute of Signal Processing Tampere University of Technology . Box 553 33101 Tampere Finland Correspondence should be addressed to John Dougherty Received 24 August 2007 Accepted 11 January 2008 Recommended by Aniruddha Datta The Boolean network paradigm is a simple and effective way to interpret genomic systems but discovering the structure of these networks remains a difficult task. The minimum description length MDL principle has already been used for inferring genetic regulatory networks from time-series expression data and has proven useful for recovering the directed connections in Boolean networks. However the existing method uses an ad hoc measure of description length that necessitates a tuning parameter for artificially balancing the model and error costs and as a result directly conflicts with the MDL principle s implied universality. In order to surpass this difficulty we propose a novel MDL-based method in which the description length is a theoretical measure derived from a universal normalized maximum likelihood model. The search space is reduced by applying an implementable analogue of Kolmogorov s structure function. The performance of the proposed method is demonstrated on random synthetic networks for which it is shown to improve upon previously published network inference algorithms with respect to both speed and accuracy. Finally it is applied to time-series Drosophila gene expression measurements. Copyright 2008 John Dougherty et al. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.