TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Bias in phylogenetic tree reconciliation methods: implications for vertebrate genome evolution"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Critical Care giúp cho các bạn có thêm kiến thức về ngành y học đề tài: Bias in phylogenetic tree reconciliation methods: implications for vertebrate genome evolution. | Open Access Bias in phylogenetic tree reconciliation methods implications for vertebrate genome evolution Matthew W Hahn Address Department of Biology and School of Informatics E. 3rd Street Indiana University Bloomington IN 47405 USA. Email mwh@ Published 16 July 2007 Received 15 May 2007 Genome Biology 2007 8 R141 doi gb-2007-8-7-r141 Accepted 16 July 2007 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2007 8 7 R141 2007 Hahn licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract Background Comparative genomic studies are revealing frequent gains and losses of whole genes via duplication and pseudogenization. One commonly used method for inferring the number and timing of gene gains and losses reconciles the gene tree for each gene family with the species tree of the taxa considered. Recent studies using this approach have found a large number of ancient duplications and recent losses among vertebrate genomes. Results I show that tree reconciliation methods are biased when the inferred gene tree is not correct. This bias places duplicates towards the root of the tree and losses towards the tips of the tree. I demonstrate that this bias is present when tree reconciliation is conducted on both multiple mammal and Drosophila genomes and that lower bootstrap cut-off values on gene trees lead to more extreme bias. I also suggest a method for dealing with reconciliation bias although this method only corrects for the number of gene gains on some branches of the species tree. Conclusion Based on the results presented it is likely that most tree reconciliation analyses show biases unless the gene trees used are exceptionally well-resolved and .

• Báo cáo khoa học
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• nghiên cứu y học
• báo cáo y học
• kiến thức y học
• CÁCH TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• PHƯƠNG PHÁP TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• KĨ NĂNG TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• MẸO TRÌNH BÁY BÁO CÁO
• TRÌNH BÀY BÁO CÁO KHOA HỌC
• TRÌNH BÀY LUẬN VĂN BÁO CÁO
• Hình thức báo cáo thực tập
• Báo cáo thực tập tốt nghiệp
• Báo cáo thực tập
• Trình bày báo cáo thực tập
• Hướng dẫn trình bày báo cáo
• Hướng dẫn viết báo cáo
• Mẫu báo cáo
• Cách trình bày luận văn
• Cách trình bày khóa luận
• Thể thức của báo cáo
• trình bày luận văn
• báo cáo nông nghiệp
• báo cáo y dược
• báo cáo sinh học
• chăn nuôi lợn
• Kỹ năng trình bày báo cáo
• Kỹ năng thuyết trình
• Thiết kế slide
• Định dạng văn bản
• Nội dung trình bày báo cáo
• Thời gian thuyết trình
• Thực tập chuyên ngành
• Hướng dẫn viết tiểu luận
• Cấu trúc báo cáo
• Cách thể hiện báo cáo
• Nội dung báo cáo
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• tài liệu báo cáo nghiện cứu khoa học
• báo cáo ngành văn học
• báo cáo tiếng anh
• báo cáo khoa học
• thơ lục bát
• chăn nuôi
• báo cáo ngành kỹ thuật
• báo cáo ngành nông nghiệp
• báo cáo ngành ngoại ngữ
• báo cáo kinh tế
• báo cáo ngành tin học
• tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học
• báo cáo ngành y học
• trình bày thông tin tài sản thiếu trong báo cáo tài chính
• trình bày thông tin tài sản
• trình bày thông tin tài sản trong báo cáo tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính
• tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính doanh nghiệp
• báo cáo tài chính
• Tài liệu về trình bày đồ án
• Trình bày đồ án tốt nghiệp
• Quy định trình bày báo cáo cáo chuyên đề
• Quy định trình bày bài tập lớn
• Viện Đại học Mở Hà Nội
• mẫu báo cáo thực tập tốt nghiệp
• trình bày luận án
• cách viết báo cáo tốt nghiệp
• báo cáo tốt nghiệp
• Báo cáo phân tích ngành hàng hải
• báo cáo khoa học kinh tế
• báo cáo kỹ thuật