TAILIEUCHUNG - Restriction fragment length polymorphism analysis (RFLP) of some Streptomyces strains from soil

To separate the unknown Streptomyces strains isolated from soil samples, the interspacer regions of 16S-23S rDNA of 14 isolates were amplified with PCR (polymerase chain reaction) and digested with three restriction endonucleases, namely, Bsp143I, HaeIII and MnlI. The restriction patterns were used for RFLP (restriction fragment length polymorphism) analysis. | Turk J Biol 25 (2001) 397-404 © TÜB‹TAK Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis (RFLP) of Some Streptomyces Strains from Soil Ekrem ATALAN Yüzüncü Y›l Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Van - TURKEY Received: Abstract: To separate the unknown Streptomyces strains isolated from soil samples, the interspacer regions of 16S-23S rDNA of 14 isolates were amplified with PCR (polymerase chain reaction) and digested with three restriction endonucleases, namely, Bsp143I, HaeIII and MnlI. The restriction patterns were used for RFLP (restriction fragment length polymorphism) analysis. A dendrogram were constructed using the unweighed pair group method using arithmetic averages algorithm (UPGMA) after analysis restriction patterns. Five RFLP groups were obtained and one test strain was left as a single member group. RFLP profile indicated that unknown strains could be identified with data based on the interspacer region of 16S-23S DNA rapid and quickly. Key Words: Fingerprinting, intergenic rDNA, RFLP, Streptomyces Toprakta ‹zole Edilen Baz› Streptomyces Sufllar›n›n Restriksiyon Fragment Uzunluk Polimorfizm (RFLP) ile Analizi Özet: Toprakta izole edilen ve bilinmeyen Streptomyces sufllar›n› birbirinden ay›rmak için 16S-23S rDNA segmenti polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullan›larak amplifiye edildi. Elde edilen DNA segmenti Bsp1431, HaeIII ve MnlI restriksiyon enzimleri ile muamele edilerek kesildi. Elde edilen bandlar restriksiyon fragmentlerinin uzunluk polimorfizm (RFLP) analizleri için kullan›ld›. Aritmetik ortalama logaritmas› ve a¤›rl›ks›z çift metodu kullan›larak sonuçlar dendogram fleklinde sunuldu. Test organizmalar› 5 gruba ayr›ld› ve 1 test organizmas› da tek üyeli grup oluflturdu. Bilinmeyen organizmalar 16S-23S rDNA interspacer (ara bölge) segmenti RFLP analizi ile teflhisi yap›ld›. Anahtar Sözcükler: Fingerprinting, intergenik rDNA, RFLP, Streptomyces 397 Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis (RFLP) of

• Sinh học
• Intergenic rDNA
• Polymorphism analysis
• Streptomyces strains
• Polymerase chain reaction
• Nucleic acid
• BMC Veterinary Research
• 16S rRNA gene
• 16S 23S rDNA intergenic spacer region
• Trueperella pyogenes
• Diverse pyogenic
• acid Nucleic
• tìm hiểu acid Nucleic
• nghiên cứu acid Nucleic
• chuyển hóa acid Nucleic
• quá trình chuyển hóa acid Nucleic
• điều chế acid Nucleic
• giáo trình Nucleic Acid
• bài giảng Nucleic Acid
• tài liệu Nucleic Acid
• đề cương Nucleic Acid
• Sơ đồ phân giải nucleic acid
• Phân loại nucleic acid trong tế bào
• Liên kết diestephosphoric
• Cấu trúc bậc I của nucleic acid
• Sinh tổng hợp nucleic acid
• Trắc nghiệm Hóa sinh
• Trắc nghiệm Acid nucleic
• Ôn tập môn Hóa sinh
• Câu hỏi trắc nghiệm Acid nucleic
• Bài tập trắc nghiệm Acid nucleic
• Trắc nghiệm Acid nucleic có đáp án
• Base nitơ trong thành phần acid nucleic
• Thành phần hóa học chính của ARN
• Bài giảng Hóa học acid nucleic
• Hóa học acid nucleic
• Cấu trúc của acid nucleic
• Chức năng sinh học của Nucleotide
• Cấu tạo acid nucleic
• Bài giảng Hóa sinh đại cương
• Hóa sinh đại cương
• Thành phần hóa học acid nucleic
• Cấu tạo của nucleic acid
• Sinh tổng hợp acid nucleic
• Phương pháp nghiên cứu Nucleic Acid
• Cấu trúc của các Nucleotide
• Chức năng của RNA
• Sinh tổng hợp Nucleotide
• giải phẫu bệnh
• y cơ sở
• ngoại cơ sở
• bệnh học đại cương
• Bài giảng Hóa sinh
• Cấu trúc acid nucleic
• Thành phần cấu tạo của acid nucleic
• Chất tổng hợp dùng trong trị liệu
• Kiến thức hóa sinh Dược sĩ
• khoa học
• tự nhiên
• sinh học
• SỰ CHUYỂN HOÁ CỦA NUCLEIC ACID
• Hóa học và ứng dụng
• Bài giảng Nucleotide và Acid Nucleic
• Nucleotide và Acid Nucleic
• Cấu trúc Nucleotide
• nghiên cứu sinh học
• đặc điểm của axid nucleic
• Nghiên cứu Nucleic Acid
• tính chất của Nucleic Acid
• Thành phần hoá học nucleic acid
• cấu trúc nucleic acid
• chức năng nucleic acid
• công nghệ sinh học
• sinh học phân tử
• sinh học di truyền
• Axit nucleic
• Phân loại Acid nucleic
• Cấu trúc Acid desoxyribonucleic
• Acid ribonucleic
• Chức năng của Acid desoxyribonucleic
• Bài giảng Nucleoprotein và acid nucleic
• Cấu tạo của acid nucleice
• chức năng sinh học của nucleotid
• Hóa trị liệu