TAILIEUCHUNG - Báo cáo: So sánh đặc điểm và phương pháp xây dựng thư viện genomic DNA, thư viện cDNA

Thư viện bộ gene của một sv là tập hợp tất cả các trình tự DNA cấu thành bộ gene được gắn vào vector, sau đó được đưa vào tế bào chủ. Các tế bào chủ được nuôi cấy trên môi trường tạo dòng. Thư viện cDNA là tập hợp tất cả các bản sao từ mRNA của một tế bào, trong một điều kiện sinh lí nhất định, tại một thời điểm nhất định. | SO SÁNH ĐẶC ĐIỂM & PHƯƠNG PHÁP XÂY DỰNG THƯ VIỆN GENOMIC DNA, THƯ VIỆN cDNA. Nhóm 3: Huỳnh Minh Trí Phạm Thị Sương Phạm Thị Lan Bùi Thị Kim Ly NỘI DUNH CHÍNH: THƯ VIỆN GENOMIC DNA THƯ VIỆN cDNA PHƯƠNG PHÁP XÂY DỰNG SO SÁNH Thư viện genomic DNA: Thư viện bộ gene của một sv là tập hợp tất cả các trình tự DNA cấu thành bộ gene được gắn vào vector, sau đó được đưa vào tế bào chủ. Các tế bào chủ được nuôi cấy trên môi trường tạo dòng. Thư viện cDNA là tập hợp tất cả các bản sao từ mRNA của một tế bào, trong một điều kiện sinh lí nhất định, tại một thời điểm nhất định. Thư viện cDNA: TUYỂN CHỌN DÒNG MỤC TIÊU: Để có thể phân lập dòng tế bào chủ tái tổ hợp chứa gene mục tiêu trong một thư viện DNA hay một thư viện cDNA, người ta phải sử dụng các phương pháp sàng lọc. Thông thường các phương pháp sàng lọc được xây dựng dựa trên việc sử dụng mẫu dò DNA. Mẫu dò DNA (probe) là một đoạn oliogonucleotide được đánh dấu và bổ sung hoặc bổ sung một phần với gene mục tiêu. TUYỂN CHỌN DÒNG MỤC TIÊU: Gene được biểu hiện trong tế bào chủ là vi khuẩn: + Lai miễn dịch (Western blot) + Hoạt tính enzyme + Bổ trợ đột biến (gene ngoại lai đồng dạng với gene của tế bào chủ) Gene ngoại lai không biểu hiện trong tế bào chủ: Lai insitu: + Lai khuẩn lạc (colony hybridization): vector là plasmid + Lai plaque (plaque colonization): vector là phage SO SÁNH: Nội dung Tạo thư viện genomic DNA Tạo thư viện cDNA Mục đích Nhằm lưu trữ thông tin di truyền trong các tế bào chủ để phục vụ các hoạt động nghiên cứu. - Đều đưa vào tế bào chủ để tạo dòng. Vector thường sử dụng Phage I, YAC, Cosmid Phage ƛ: ƛgt10, ƛgt11, ƛ11/18/23/ZAP Đối tượng - DNA tế bào - Thường được lập cho Prokaryode (vì genome, biểu hiện gen Eukaryode phức tạp, chưa làm hết) - mRNA trưởng thành của 1 loại mô nhất định - Thường được lập cho Eukaryode. SO SÁNH: Nội dung Tạo thư viện genomic DNA Tạo thư viện cDNA Biểu hiện Một thư viện genomic DNA đại diện cho 1 loài. Một cơ thể có nhiều thư viện cDNA khác nhau đặc trưng cho từng loại tổ chức chuyên hóa trong điều kiện sinh lí, thời điểm nhất định. Các giai đoạn chính Tách chiết DNA Cắt DNA Gắn DNA vào vector Đóng gói các dòng tái tổ hợp Xâm nhiễm vào TB vật chủ Tạo dòng Chọn lọc kích thước của cDNA Gắn các cDNA với các nhánh của bacteriophage Phân tích các đoạn chèn cDNA Tạo thư viện cDNA hoàn chỉnh Khuếch đại thư viện cDNA SO SÁNH: Nội dung Tạo thư viện genomic DNA Tạo thư viện cDNA Phương pháp sàng lọc - Dựa vào các gen chỉ thị trên vector. - Thường sử dụng: lai khuẩn lạc - Dựa vào các gen chỉ thị - Thường sử dụng: lai plaque - Ưu điểm - Dễ thao tác hơn đối với RNA - Có thể xác định được bản đồ giới hạn gen - Các dòng cDNA chứa trình tự mã hóa liên tục của 1 gene - TV cDNA được tạo ra từ 1 loại TB mô có nhiều cDNA mã hóa cho các Pr tương ứng làm giảm nhẹ việc xác định dòng mong muốn từ TV gen. SO SÁNH: Nội dung Tạo thư viện genomic DNA Tạo thư viện cDNA Nhược điểm Tạo ra các dòng mang các đoạn chèn DNA khác nhau nhưng gối chồng lên nhau - Quy trình nghiêm ngặt: mRNA dễ bị phân hủy - Nhiều bước phức tạp. Ứng dụng - Giải mã thông tin DT trong genome, đặc biệt là cấu trúc intron & exon trong 1 gene xác định. - Bảo tồn gene. Nghiên cứu sự biểu hiện của một gene xác định cùng các vấn đề điều hòa biểu hiện tương tác gene. Tài liệu tham khảo : Nguồn Tìm: chương 207, kỹ thuật tạo thư viện genomic DNA và thư viện cDNA. Nguyễn Hoàng Lộc & cộng sự, giáo trình công nghệ DNA tái tổ hợp, Nxb ĐHQG

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.