TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Cross-kingdom patterns of alternative splicing and splice recognition"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Critical Care giúp cho các bạn có thêm kiến thức về ngành y học đề tài: Cross-kingdom patterns of alternative splicing and splice recognition. | Open Access Cross-kingdom patterns of alternative splicing and splice recognition Abigail M McGuire Matthew D Pearson Daniel E Neafsey and James E Galagan Address The Broad Institute of MIT and Harvard Cambridge Center Cambridge MA 02142 USA. These authors contributed equally to this work. Correspondence Abigail M McGuire. Email amcguire@ Published 5 March 2008 Genome Biology 2008 9 R50 doi 186 gb-2008-9-3-r50 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2008 9 3 R50 Received 15 October 2007 Revised 28 January 2008 Accepted 5 March 2008 2008 Manson McGuire et al. licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract Background Variations in transcript splicing can reveal how eukaryotes recognize intronic splice sites. Retained introns RIs commonly appear when the intron definition ID mechanism of splice site recognition inconsistently identifies intron-exon boundaries and cassette exons CEs are often caused by variable recognition of splice junctions by the exon definition ED mechanism. We have performed a comprehensive survey of alternative splicing across 42 eukaryotes to gain insight into how spliceosomal introns are recognized. Results All eukaryotes we studied exhibit RIs which appear more frequently than previously thought. CEs are also present in all kingdoms and most of the organisms in our analysis. We observe that the ratio of CEs to RIs varies substantially among kingdoms while the ratio of competing 3 acceptor and competing 5 donor sites remains nearly constant. In addition we find the ratio of CEs to RIs in each organism correlates with the length of its introns. In all 14 fungi we examined as well as in most of the 9 protists

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.