TAILIEUCHUNG - Đánh giá mức độ biểu hiện gen và xây dựng mô hình cấu trúc không gian của protein giàu methionine ở cây sắn bằng công cụ tin sinh học

Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm khai thác mức độ biểu hiện của 52 gen mã hóa MRP chưa rõ chức năng ở sắn dựa trên việc tái phân tích các dữ liệu microarray trong điều kiện xử lý stress phi sinh học. | Tạp chí Khoa học và Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam - Số Chuyên đề dành cho Đoàn thanh niên VAAS 133 2022 ĐÁNH GIÁ MỨC ĐỘ BIỂU HIỆN GEN VÀ XÂY DỰNG MÔ HÌNH CẤU TRÚC KHÔNG GIAN CỦA PROTEIN GIÀU METHIONINE Ở CÂY SẮN BẰNG CÔNG CỤ TIN SINH HỌC Nguyễn Hữu Kiên1 Tạ ị Diệu Linh1 Chu Đức Hà2 Nguyễn Hà My3 La Việt Hồng3 Lê ị Ngọc Quỳnh4 Nguyễn Quỳnh Anh5 Bùi ị u Hương 5 Đồng Huy Giới5 TÓM TẮT ực vật cần điều kiện môi trường tối ưu để sinh trưởng và phát triển nên cũng là nhóm bị chịu ảnh hưởng nhiều nhất bởi các stress phi sinh học như nóng lạnh mặn hạn hán và lũ lụt. Trong đó các protein giàu methionine MRP là một trong những phân tử dễ bị ảnh hưởng bởi những stress phi sinh học này. Ở nghiên cứu này các gen mã hóa 52 MRP chưa rõ chức năng trên đối tượng cây sắn Mahibot esculenta giống mô hình KU50 có mức độ biểu hiện khác nhau ở các dữ liệu RNA-Seq trong điều kiện xử lý mặn hạn thiếu hụt dinh dưỡng và xử lý polyethylene glycol 6000. Kết quả đã xác định được tổng số 28 gen mã hóa MRP chưa rõ chức năng nhưng có mức độ biểu hiện đáp ứng trong ít nhất một điều kiện xử lý bất lợi fold-change 2 . được xác định là gen đáp ứng trong tất cả các điều kiện stress phi sinh học trong khi và là hai gen có đáp ứng tăng 41 3-lần và giảm mạnh nhất -82 3-lần ở lá khi xử lý hạn. Phân tích cho thấy rất nhiều các yếu tố điều hòa cis- cảm ứng hormone đặc biệt là yếu tố đáp ứng abscisic acid jasmonic acid và ethylene đã được tìm thấy trên vùng promoter của 28 gen đáp ứng bất lợi. Xây dựng mô hình 3D cho thấy các MRP chủ yếu được cấu tạo từ các dạng xoắn alpha kết hợp với nếp gấp beta. Tóm lại kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những dẫn liệu quan trọng nhằm đề xuất ra các gen ứng viên cho phân tích chức năng gen liên quan đến chống chịu stress phi sinh học ở cây sắn. Từ khóa Protein giàu methionine cây sắn biểu hiện stress phi sinh học tin sinh học I. ĐẶT VẤN ĐỀ chìa khóa để hướng đến canh tác bền vững thích Ở Việt Nam canh tác nông nghiệp đang

• Nông nghiệp
• Công nghệ nông nghiệp
• Protein giàu methionine
• Stress phi sinh học
• Tin sinh học
• Gen mã hóa MRP
• Nông nghiệp công nghệ cao
• Nông nghiệp công nghệ cao ở Cần Thơ
• Đặc trưng nông nghiệp công nghệ cao
• Tiền đề nông nghiệp công nghệ cao
• Phát triển nông nghiệp công nghệ cao
• Lý luận nông nghiệp công nghệ cao
• Nông nghiệp công nghệ cao ở Việt Nam
• Khó khăn phát triển nông nghiệp CN cao
• Giải pháp nông nghiệp công nghệ cao
• Tình hình nông nghiệp công nghệ cao
• Nông nghiệp công nghệ cao tại Cần Thơ
• Thực trạng nông nghiệp công nghệ cao
• Luận văn Thạc sĩ Địa lý học
• Khoa học công nghệ nông thôn phía Bắc
• Báo cáo Khoa học công nghệ
• Nông nghiệp phát triển nông thôn phía Bắc
• Công nghệ thủy lợi
• Công nghệ trồng trọt
• Công nghệ bảo vệ thực vật
• Chủ trương phát triển nông nghiệp công nghệ cao
• Chính sách phát triển nông nghiệp công nghệ cao
• Hỗ trợ phát triển nông nghiệp
• Hiện đại hóa nông nghiệp
• Nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao
• Công tác khuyến nông lâm ngư
• Quy hoạch khu nông nghiệp
• Tình hình sản xuất nông lâm ngư nghiệp
• Luận văn nông nghiệp
• Quy hoạch nông nghiệp ứng dụng công nghệ
• Báo cáo nông lâm nghiệp
• Ứng dụng công nghệ trong nông nghiệp
• Nông nghiệp ứng dụng
• Phát triển nông nghiệp
• Hiệu quả kinh tế
• Nông nghiệp công nghệ cao tại Lâm Đồng
• Sản xuất nông nghiệp
• Giá trị sản xuất nông nghiệp
• Tổng luận Nông nghiệp công nghệ cao
• Nông nghiệp Việt Nam
• Đa dạng hóa thương hiệu
• Nông nghiệp bốn chấm không
• Kỷ nguyên công nghệ mới
• Nông nghiệp thông minh
• Thái độ của nông dân
• Hoạch định chiến lược phát triển nông nghiệp
• Ứng dụng công nghệ kỹ thuật cao
• Luận văn Thạc sĩ Kinh tế
• Tài chính ngân hàng
• Nông nghiệp sạch
• Cho vay nông nghiệp
• Chính sách tín dụng
• Tín dụng cho phát triển nông nghiệp
• Tín dụng cho phát triển nông thôn
• Nông thôn ứng dụng công nghệ cao
• Nông nghiệp nông thôn Việt Nam
• Sản xuất nông nghiệp của thế giới
• Nền nông nghiệp công nghệ cao
• Tạp chí Khoa học và Công nghệ Việt Nam
• Sự tiến hóa của nông nghiệp
• Đổi mới công nghệ
• Cách mạng công nghiệp lần thứ 4
• Công nghệ 4 0 trong nông nghiệp
• Phát triển sản xuất nông nghiệp
• Phát triển cơ sở hạ tầng
• Ứng dụng công nghệ cao trong nông nghiệp
• Thực trạng sản xuất nông nghiệp
• Giải pháp sản xuất nông nghiệp
• Quy mô sản xuất nông nghiệp
• Phát triển nông thôn
• Kỹ thuật sản xuất nông nghiệp
• Công nghệ sản xuất nông nghiệp
• Tiến bộ kỹ thuật nông nghiệp
• Kỹ thuật nông nghiệp
• Khoa học công nghệ
• Khoa học công nghệ ở Tiền Giang
• Vai trò của khoa học công nghệ
• Nông nghiệp nông thôn Tiền Giang
• Phát triển nông nghiệp nông thôn
• Thành tựu khoa học công nghệ
• Công nghệ sinh học
• Nông nghiệp nông thôn
• Ứng dụng công nghệ sinh học
• Vai trò công nghệ sinh học
• Khoa học công nghệ trong nông nghiệp
• Phát triển nông nghiệp bền vững
• Xây dựng nông thôn mới
• Thực trạng ngành nông nghiệp Việt Nam
• Nông nghiệp quy mô lớn
• Giải pháp phát triển sản xuất nông nghiệp
• Hội thảo phát triển nông nghiệp công nghệ cao
• Tạp chí Hoạt động Khoa học