TAILIEUCHUNG - báo cáo khoa học: " Gene-based SSR markers for common bean (Phaseolus vulgaris L.) derived from root and leaf tissue ESTs: an integration of the BMc series"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Gene-based SSR markers for common bean (Phaseolus vulgaris L.) derived from root and leaf tissue ESTs: an integration of the BMc series | Blair et al. BMC Plant Biology 2011 11 50 http 1471-2229 11 50 BMC Plant Biology RESEARCH ARTICLE Open Access Gene-based SSR markers for common bean Phaseolus vulgaris L. derived from root and leaf tissue ESTs an integration of the BMc series ZV A r A Dl ìr tvl lì I 11 I rh 1 I I I rrf 1 R I fs I s A I I I r ĩ I r vv f r 1 2 3 A I I r - I I r 1 4 Matthew W Blair Natalia Hurtado Carolina M Chavarro Monica C Munoz-iorres Martha C Giraldo Fabio Pedraza1 5 Jeff Tomkins2 Rod Wing2 6 Abstract Background Sequencing of cDNA libraries for the development of expressed sequence tags ESTs as well as for the discovery of simple sequence repeats SSRs has been a common method of developing microsatellites or SSR-based markers. In this research our objective was to further sequence and develop common bean microsatellites from leaf and root cDNA libraries derived from the Andean gene pool accession G19833 and the Mesoamerican gene pool accession DOR364 mapping parents of a commonly used reference map. The root libraries were made from high and low phosphorus treated plants. Results A total of 3 123 EST sequences from leaf and root cDNA libraries were screened and used for direct simple sequence repeat discovery. From these EST sequences we found 184 microsatellites the majority containing tri-nucleotide motifs many of which were GC rich ACC AGC and AGG in particular . Di-nucleotide motif microsatellites were about half as common as the tri-nucleotide motif microsatellites but most of these were AGn microsatellites with a moderate number of ATn microsatellites in root ESTs followed by few ACn and no GCn microsatellites. Out of the 184 new SSR loci 120 new microsatellite markers were developed in the BMc Bean Microsatellites from cDNAs series and these were evaluated for their capacity to distinguish bean diversity in a germplasm panel of 18 genotypes. We developed a database with images of the microsatellites and their polymorphism information content PIC which

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.