TAILIEUCHUNG - báo cáo khoa học: " Assessing the contribution of alternative splicing to proteome diversity in Arabidopsis thaliana using proteomics data"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Assessing the contribution of alternative splicing to proteome diversity in Arabidopsis thaliana using proteomics data | Severing et al. BMC Plant Biology 2011 11 82 http 1471-2229 11 82 BMC Plant Biology CORRECTION Open Access Assessing the contribution of alternative splicing to proteome diversity in Arabidopsis thaliana using proteomics data Edouard I Severing1 2 3 Aalt DJ van Dijk1 and Roeland CHJ van Ham1 2 3 4 Abstract Background Large-scale analyses of genomics and transcriptomics data have revealed that alternative splicing AS substantially increases the complexity of the transcriptome in higher eukaryotes. However the extent to which this complexity is reflected at the level of the proteome remains unclear. On the basis of a lack of conservation of AS between species we previously concluded that AS does not frequently serve as a mechanism that enables the production of multiple functional proteins from a single gene. Following this conclusion we hypothesized that the extent to which AS events contribute to the proteome diversity in Arabidopsis thaliana would be lower than expected on the basis of transcriptomics data. Here we test this hypothesis by analyzing two large-scale proteomics datasets from Arabidopsis thaliana. Results A total of only 60 AS events could be confirmed using the proteomics data. However for about 60 of the loci that based on transcriptomics data were predicted to produce multiple protein isoforms through AS no isoform-specific peptides were found. We therefore performed in silico AS detection experiments to assess how well AS events were represented in the experimental datasets. The results of these in silico experiments indicated that the low number of confirmed AS events was the consequence of a limited sampling depth rather than in vivo under-representation of AS events in these datasets. Conclusion Although the impact of AS on the functional properties of the proteome remains to be uncovered the results of this study indicate that AS-induced diversity at the transcriptome level is also expressed at the proteome level. .

• Báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• công trình nghiên cứu về y học
• tài liệu về y học
• cách trình bày báo cáo
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• luận văn mẫu
• người lính việt nam
• sau chiến tranh
• tuyển tập báo cáo khoa học
• báo cáo ngành triết học
• báo cáo ngành lịch sử
• báo cáo ngành văn học
• nghiên cứu khoa học
• báo cáo về văn học
• báo cáo triết học
• báo cáo văn học
• chuyên đề văn học
• văn học nghệ thuật
• văn học Việt NAm
• báo cáo ngành toán học
• báo cáo ngành vật lý
• báo cáo ngành chăn nuôi
• văn học Trung Hoa
• báo cáo khoa học kinh tế
• Kỷ yếu tóm tắt báo cáo khoa học
• Báo cáo khoa học y học
• Hội nghị khoa học tim mạch
• Báo cáo khoa học y khoa
• Tăng huyết áp
• báo cáo sinh học
• bảo tồn nguồn gen
• báo cáo ngành kỹ thuật
• Báo cáo quản lý chất thải sinh hoạt
• Báo cáo khoa học môi trường
• Báo cáo khoa học công nghệ
• Nghiên cứu khoa học về môi trường
• Đề tài nghiên cứu khoa học
• Báo cáo nghiên cứu khoa học