TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Research Article Information-Theoretic Inference of Large Transcriptional Regulatory Networks"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành hóa học dành cho các bạn yêu hóa học tham khảo đề tài: Research Article Information-Theoretic Inference of Large Transcriptional Regulatory Networks | Hindawi Publishing Corporation EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology Volume 2007 Article ID 79879 9 pages doi 2007 79879 Research Article Information-Theoretic Inference of Large Transcriptional Regulatory Networks Patrick E. Meyer Kevin Kontos Frederic Lafitte and Gianluca Bontempi ULB Machine Learning Group Computer Science Department Universite Libre de Bruxelles 1050 Brussels Belgium Received 26 January 2007 Accepted 12 May 2007 Recommended by Juho Rousu The paper presents MRNET an original method for inferring genetic networks from microarray data. The method is based on maximum relevance minimum redundancy MRMR an effective information-theoretic technique for feature selection in supervised learning. The MRMR principle consists in selecting among the least redundant variables the ones that have the highest mutual information with the target. MRNET extends this feature selection principle to networks in order to infer gene-dependence relationships from microarray data. The paper assesses MRNET by benchmarking it against RELNET CLR and ARACNE three state-of-the-art information-theoretic methods for large up to several thousands of genes network inference. Experimental results on thirty synthetically generated microarray datasets show that MRNET is competitive with these methods. Copyright 2007 Patrick E. Meyer et al. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. 1. INTRODUCTION Two important issues in computational biology are the extent to which it is possible to model transcriptional interactions by large networks of interacting elements and how these interactions can be effectively learned from measured expression data 1 . The reverse engineering of transcriptional regulatory networks TRNs from expression data alone is far from trivial because of the combinatorial nature .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.