TAILIEUCHUNG - Nghiên cứu đặc tính protein và phân tích in silico mức độ biểu hiện của họ gen CaSWEET ở cây Đậu gà (Cicer arietinum)
Trong nghiên cứu này, đặc tính cơ bản của họ protein vận chuyển đường sucrose, SWEET (sugars will eventually be exported transporter), đã được phân tích trên cây đậu gà (Cicer arietinum). Kết quả đã cho thấy họ CaSWEET có kích thước trong khoảng 230 đến 296 axít amin, trọng lượng phân tử đạt 25,67 đến 33,47 kDa. Phân tích các đặc tính hóa sinh đã chỉ ra rằng họ CaSWEET có tính kỵ nước, phần lớn các phân tử có giá trị điểm đẳng điện lớn hơn 7 và có tính ổn định trong điều kiện in vitro. | ISSN: 1859-2171 TNU Journal of Science and Technology 197(04): 71 - 76 NGHIÊN CỨU ĐẶC TÍNH PROTEIN VÀ PHÂN TÍCH IN SILICO MỨC ĐỘ BIỂU HIỆN CỦA HỌ GEN CaSWEET Ở CÂY ĐẬU GÀ (Cicer arietinum) Chu Đức Hà1*, Phùng Thị Vượng2,3, Nguyễn Hà My1,2, Phạm Thị Lý Thu1, Phạm Phương Thu2, La Việt Hồng2 1 Viện Di truyền Nông nghiệp (VAAS), 2Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2, 3 Trường THPT Ngô Quyền - Ba Vì, Hà Nội TÓM TẮT Trong nghiên cứu này, đặc tính cơ bản của họ protein vận chuyển đường sucrose, SWEET (sugars will eventually be exported transporter), đã được phân tích trên cây đậu gà (Cicer arietinum). Kết quả đã cho thấy họ CaSWEET có kích thước trong khoảng 230 đến 296 axít amin, trọng lượng phân tử đạt 25,67 đến 33,47 kDa. Phân tích các đặc tính hóa sinh đã chỉ ra rằng họ CaSWEET có tính kỵ nước, phần lớn các phân tử có giá trị điểm đẳng điện lớn hơn 7 và có tính ổn định trong điều kiện in vitro. Dự đoán bằng TargetP cho thấy đa số các CaSWEET phân bố ở hệ thống tiết. Các gen CaSWEET được khai thác thông tin trong điều kiện thường và stress phi sinh học dựa vào một số cơ sở dữ liệu giải hệ phiên mã. Trong điều kiện thường, hầu hết các gen CaSWEET có biểu hiện mạnh ở ít nhất một cơ quan trên cây. Đặc biệt, CaSWEET19 được xác định là gen có biểu hiện đặc thù ở cả 11 vị trí trong điều kiện thường. Bốn gen CaSWEET đã được xác định có mức độ phiên mã đáp ứng với stress mặn và hạn ở mô rễ. Trong đó, gen CaSWEET05 biểu hiện mạnh nhất trong stress hạn, đạt 2,43 lần so với đối chứng và CaSWEET17 là gen có đáp ứng với stress mặn, tương ứng 2,17 lần so với đối chứng. Từ khóa: Đậu gà, SWEET, mức độ biểu hiện, đặc tính, tin sinh học Ngày nhận bài: 04/3/2019; Ngày hoàn thiện: 19/3/2019; Ngày duyệt đăng: 16/4/2019 ANALYSIS OF PROTEIN FEATURES AND IN SILICO EXPRESSION PROFILES OF CaSWEET
đang nạp các trang xem trước
