TAILIEUCHUNG - Phân loại các chủng vi khuẩn Bacillus bằng phương pháp phân tích trình tự Nucleotit của gien 16S-ARN

Bài viết trình bày sử dụng phương pháp phân loại truyền thống, các nhà khoa học còn kết hợp với phương pháp sinh học phân tử, phân tích trình tự của gien 16S-ARN. | Phõn loại cỏc chủng vi khuẩn Bacillus bằng phương phỏp phõn tớch trỡnh tự Nucleotit của gien 16S-ARN 28(1): 63-67 Tạp chí Sinh học 3-2006 phân loại các chủng vi khuẩn Bacillus bằng ph−ơng pháp phân tích trình tự nucleotit của gien 16s-ARN Tăng Thị Chính Viện Công nghệ môi trường Trước những năm 90 của thế kỷ XX, các b. Nhân đoạn gien 16S-ARN bằng kỹ thuật PCR chủng vi khuẩn(VK) được phân loại chủ yếu Đoạn gien 16S-ARN của các chủng Bacillus bằng các khóa phân loại vi sinh vật truyền thống (khóa phân loại của Bergey’s manual); người ta được nhân bằng kỹ thuật PCR nhờ sử dụng cặp dựa vào các đặc điểm hình thái của khuẩn lạc và mồi đặc hiệu có trình tự như sau: tế bào, các đặc điểm sinh lý sinh hóa, khả năng Mồi xuôi GF1: 5’-TAACACATGGAAGTC- sử dụng các nguồn đường của các chủng VK để GAACG-3’. phân loại. Tuy nhiên, việc phân loại bằng Mồi ngược GR1: 5’-GGTGTGACGGGC- ph−ơng pháp này đôi khi không chính xác, đặc GGTCTGTACAAG-3’. biệt là khi phân loại các chủng VK đến loài. Vì các chủng vi sinh vật cùng nhóm thường có rất PCR được thực hiện với chu trình nhiệt như nhiều đặc điểm giống nhau. Vì vậy, ngày nay, sau: 94°C: 5’, (94°C: 1’, 55°C: 45’’, 72°C: 1’’) lặp ngoài việc sử dụng ph−ơng pháp phân loại lại 30 chu kỳ; 72°C: 8’. Sản phẩm PCR được bảo truyền thống, các nhà khoa học còn kết hợp với quản ở 4°C và được kiểm tra bằng điện di trên gel ph−ơng pháp sinh học phân tử, phân tích trình tự agaroza 1%, nhuộm bản gel với ethidium bromit của gien 16S-ARN để phân loại. và xem điện di đồ dưới ánh sáng của đèn cực tím. Plasmit pGEM-T* được mở vòng bằng I. ph−ơnng pháp nghiên cứu enzym EcoRI, điểm cắt của enzym EcoRI sẽ mở vòng plasmit để gắn ADN. 1. Vi sinh vật Các kỹ thuật tái tổ hợp và tách chiết ADN Chủng XL1-Blue, plasmit PGEM-T* plasmit được tiến hành theo Sambrook và cs. [6]. vectơ mua của h]ng Promega, Mỹ. Việc xác định trình tự của gien được tiến 2. Hóa chất hành theo ph−ơng pháp chu kỳ nhiệt của h]ng .

• Sinh học
• Phân loại các chủng vi khuẩn Bacillus
• Chủng vi khuẩn Bacillus
• Phân tích trình tự Nucleotit
• Nucleotit của gien 16S ARN
• Trình tự của gien 16S ARN