TAILIEUCHUNG - Mô hình in silico dự đoán hoạt tính kháng sốt rét
Trong đề tài này với mục tiêu nhằm nghiên cứu vấn đề xây dựng các mô hình QSAR để dự đoán hoạt tính kháng sốt rét của một số dẫn chất mới trên các chủng P. falciparum khác nhau. bài viết để nắm rõ nội dung chi tiết. | Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 15 * Phụ bản của Số 1 * 2011 Nghiên cứu Y học MÔ HÌNH IN SILICO DỰ ĐOÁN HOẠT TÍNH KHÁNG SỐT RÉT Thái Khắc Minh*, Võ Vân Anh*, Nguyễn Đắc Chí* TÓM TẮT Giới thiệu: Sốt rét là bệnh dịch nguy hiểm ở các nước đang phát triển và nhu cầu cấp thiết hiện nay là tìm ra những thuốc mới có hiệu quả trên cả dòng Plasmodium falciparum đề kháng, giá cả phải chăng. Mục tiêu: Xây dựng các mô hình QSAR để dự đoán hoạt tính kháng sốt rét của một số dẫn chất mới trên các chủng P. falciparum khác nhau. Phương pháp: Nghiên cứu này tiến hành thu thập dữ liệu gần 1700 chất thuộc các nhóm cấu trúc khác nhau từ nhiều bài báo và ứng dụng thuật toán bình phương tối thiểu từng phần để xây dựng 5 mô hình hồi qui tuyến tính dự đoán hoạt tính kháng sốt rét trên máy tính. Các mô hình này được xây dựng từ các nhóm chất có hoạt tính kháng sốt rét thử nghiệm trên 5 dòng tế bào đề kháng chloroquin (K1, FcB1, NF54, Dd2, W2) với phương pháp thử nghiệm là đo độ hấp thu phóng xạ, đo quang và đếm huỳnh quang. Kết quả: Kết quả 5 mô hình (K1-1, FcB1-1, NF54-1, Dd2-1, W2-1) có giá trị R2 của cả tập xây dựng, đánh giá chéo và tập ngoại đều trong khoảng 0,57 – 0,86, RMSE trong khoảng từ 0,28 – 0,94, cho thấy khả năng dự đoán đúng trên 50% và sai số giữa giá trị dự đoán và giá trị thực nghiệm là chấp nhận được. Các mô hình này được ứng dụng dự đoán hoạt tính kháng sốt rét của 11 dẫn chất nhóm chalcon, từ đó rút ra mối quan hệ cấu trúc – tác dụng của nhóm dẫn chất này. Kết luận: Mô hình QSAR/PLS cho thấy khả năng ứng dụng tốt trong dự đoán hoạt tính kháng sốt rét của một số dẫn chất chalcon. Kết quả này được sử dụng trong định hướng thiết kế và tổng hợp các phân tử mới có hoạt tính kháng sốt rét mạnh hơn. Từ khóa: Dược tin học, QSAR, PLS, Plasmodium falciparum, bệnh sốt rét. ABSTRACT IN SILICO MODEL FOR PREDICTION OF ANTIMALARIAL ACTIVITY Thai Khac-Minh, Vo Van Anh, Nguyen Dac Chi * Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 15 - Supplement of No 1 - 2011: 395 - 405 Background: Malaria is a .
đang nạp các trang xem trước
