TAILIEUCHUNG - Trình tự hoàn chỉnh của genome ty thể mang haplotype hiếm E4 của chó lưng xoáy Phú Quốc
Khoảng cách di truyền giữa mtDNA chó Phú Quốc nòi E1, E4 và và chó Pusang (EU789662) nằm chung trong 1 cụm trên cây tiến hóa lần lượt là 0,072% và 0,24% cho thấy chó Phú Quốc mang haplotype E có quan hệ rất gần với các chó Pungsan ở Triều Tiên. Mặc dù cùng haplogroup nhưng khoảng cách di truyền của chó Phú Quốc dòng E1 và E4 lại ở mức 0,23%. Trong khi đó khoảng cách di truyền giữa chó Phú Quốc dòng E1, E4 so với các chó sói xám nằm ở vị trí phân kỳ chị em trên phả hệ đồ lần lượt là 0,3, và 0,1%. Genome ty thể chó mang dòng E4 là lần đầu tiên được giải mã và phân tích trên thế giới. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 15(1): 45-54, 2017 TRÌNH TỰ HOÀN CHỈNH CỦA GENOME TY THỂ MANG HAPLOTYPE HIẾM E4 CỦA CHÓ LƯNG XOÁY PHÚ QUỐC Trần Hoàng Dũng*, Trương Nguyễn Thị Như Mai, Nguyễn Thành Công, Huỳnh Văn Hiếu Đại học Nguyễn Tất Thành * Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail: tranhoangdung1975@ Ngày nhận bài: Ngày nhận đăng: TÓM TẮT Chó lưng có xoáy Phú Quốc là nòi chó quý của Việt Nam. Việc phát hiện chó lưng xoáy Phú Quốc mang haplotype hiếm E1 và E4 với tần suất cao khi đánh giá đa dạng di truyền nòi chó này là một phát hiện bất ngờ. Trong nghiên cứu này kỹ thuật primer-walking đã được áp dụng để giải toàn bộ mtDNA (genome ty thể) của chó Phú Quốc mang haplotype E4, B1 và E1 để tìm kiếm các manh mối nguồn gốc chó Phú Quốc. Về cơ bản chiều dài của các mtDNA đều nằm trong khoảng 16,7 kb cụ thể chó E4 là bp và B1 là bp không khác biệt so với các nòi chó khác trên thế giới. Sự khác biệt chiều dài giữa mtDNA dòng E4 và B1 chủ yếu do sự khác biệt về số lần lặp lại của các motif lại nằm ở vùng điều khiển. Số lượng các gen, mã mở đầu và kết thúc của mtDNA dòng E4 tương đồng với các haplotype phổ biến khác. Khoảng cách di truyền giữa mtDNA chó Phú Quốc nòi E1, E4 và và chó Pusang (EU789662) nằm chung trong 1 cụm trên cây tiến hóa lần lượt là 0,072% và 0,24% cho thấy chó Phú Quốc mang haplotype E có quan hệ rất gần với các chó Pungsan ở Triều Tiên. Mặc dù cùng haplogroup nhưng khoảng cách di truyền của chó Phú Quốc dòng E1 và E4 lại ở mức 0,23%. Trong khi đó khoảng cách di truyền giữa chó Phú Quốc dòng E1, E4 so với các chó sói xám nằm ở vị trí phân kỳ chị em trên phả hệ đồ lần lượt là 0,3, và 0,1%. Genome ty thể chó mang dòng E4 là lần đầu tiên được giải mã và phân tích trên thế giới. Từ khóa: Chó lưng có xoáy Phú Quốc, khoảng cách di truyền, bộ gen ty thể, haplotype E4-E1, kỹ thuật PCR kích thước lớn, kỹ thuật giải trình tự cuốn chiếu MỞ ĐẦU Chó Phú Quốc là một loài chó riêng của đảo Phú Quốc (Việt Nam), có đặc điểm .
đang nạp các trang xem trước
