TAILIEUCHUNG - báo cáo khoa học: " In silico comparative analysis of SSR markers in plants"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: In silico comparative analysis of SSR markers in plants | Victoria et al. BMC Plant Biology 2011 11 15 http 1471 -2229 11 15 BMC Plant Biology RESEARCH ARTICLE Open Access In silico comparative analysis of SSR markers in plants Filipe C Victoria1 2 Luciano C da Maia 1 Antonio Costa de Oliveira1 Abstract Background The adverse environmental conditions impose extreme limitation to growth and plant development restricting the genetic potential and reflecting on plant yield losses. The progress obtained by classic plant breeding methods aiming at increasing abiotic stress tolerances have not been enough to cope with increasing food demands. New target genes need to be identified to reach this goal which requires extensive studies of the related biological mechanisms. Comparative analyses in ancestral plant groups can help to elucidate yet unclear biological processes. Results In this study we surveyed the occurrence patterns of expressed sequence tag-derived microsatellite markers for model plants. A total of 13 133 SSR markers were discovered using the SSRLocator software in non-redundant EST databases made for all eleven species chosen for this study. The dimer motifs are more frequent in lower plant species such as green algae and mosses and the trimer motifs are more frequent for the majority of higher plant groups such as monocots and dicots. With this in silico study we confirm several microsatellite plant survey results made with available bioinformatics tools. Conclusions The comparative studies of EST-SSR markers among all plant lineages is well suited for plant evolution studies as well as for future studies of transferability of molecular markers. Background In agriculture productivity is affected by environmental conditions such as drought salinity high radiation and extreme temperatures faced by plants during their life cycle that impose severe limitations to the growth and propagation restricting their genetic potential and ultimately reflecting yield losses of agricultural crops. Although

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.