TAILIEUCHUNG - báo cáo khoa học: " High levels of nucleotide diversity and fast decline of linkage disequilibrium in rye (Secale cereale L.) genes involved in frost response"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: High levels of nucleotide diversity and fast decline of linkage disequilibrium in rye (Secale cereale L.) genes involved in frost response | Li et al. BMC Plant Biology 2011 11 6 http 1471-2229 11 6 BMC Plant Biology RESEARCH ARTICLE Open Access High levels of nucleotide diversity and fast decline of linkage disequilibrium in rye Secale cereale L. genes involved in frost response 1 1 1 2 331 Yongle Li Grit Haseneyer Chris-Carolin Schon Donna Ankerst Viktor Korzun Peer Wilde Eva Bauer Abstract Background Rye Secale cereale L. is the most frost tolerant cereal species. As an outcrossing species rye exhibits high levels of intraspecific diversity which makes it well-suited for allele mining in genes involved in the frost responsive network. For investigating genetic diversity and the extent of linkage disequilibrium LD we analyzed eleven candidate genes and 37 microsatellite markers in 201 lines from five Eastern and Middle European rye populations. Results A total of 147 single nucleotide polymorphisms SNPs and nine insertion-deletion polymorphisms were found within 7 639 bp of DNA sequence from eleven candidate genes resulting in an average SNP frequency of 1 SNP 52 bp. Nucleotide and haplotype diversity of candidate genes were high with average values n X 10-3 and Hd respectively. According to an analysis of molecular variance AMOVA most of the genetic variation was found between individuals within populations. Haplotype frequencies varied markedly between the candidate genes. ScCbf14 ScVrnl and ScDhnl were dominated by a single haplotype while the other 8 genes ScCbf2 ScCbf6 ScCbf9b ScCbfll ScCbf12 ScCbf15 ScIce2 and ScDhn3 had a more balanced haplotype frequency distribution. Intra-genic LD decayed rapidly within approximately 520 bp on average. Genome-wide LD based on microsatellites was low. Conclusions The Middle European population did not differ substantially from the four Eastern European populations in terms of haplotype frequencies or in the level of nucleotide diversity. The low LD in rye compared to self-pollinating species promises a high resolution in .

• Báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• công trình nghiên cứu về y học
• tài liệu về y học
• cách trình bày báo cáo
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• luận văn mẫu
• người lính việt nam
• sau chiến tranh
• tuyển tập báo cáo khoa học
• báo cáo ngành triết học
• báo cáo ngành lịch sử
• báo cáo ngành văn học
• nghiên cứu khoa học
• báo cáo về văn học
• báo cáo triết học
• báo cáo văn học
• chuyên đề văn học
• văn học nghệ thuật
• văn học Việt NAm
• báo cáo ngành toán học
• báo cáo ngành vật lý
• báo cáo ngành chăn nuôi
• văn học Trung Hoa
• báo cáo khoa học kinh tế
• Kỷ yếu tóm tắt báo cáo khoa học
• Báo cáo khoa học y học
• Hội nghị khoa học tim mạch
• Báo cáo khoa học y khoa
• Tăng huyết áp
• báo cáo sinh học
• bảo tồn nguồn gen
• báo cáo ngành kỹ thuật
• Báo cáo quản lý chất thải sinh hoạt
• Báo cáo khoa học môi trường
• Báo cáo khoa học công nghệ
• Nghiên cứu khoa học về môi trường
• Đề tài nghiên cứu khoa học
• Báo cáo nghiên cứu khoa học