TAILIEUCHUNG - Xây dựng quy trình khuếch đại và giải trình tự gen APC
Nghiên cứu được thực hiện với mục tiêu nhằm xây dựng quy trình khuếch đại toàn bộ 15 exon của gen APC bằng phản ứng PCR và giải trình tự gen APC. DNA được tách chiết từ máu ngoại vi của 15 người khỏe mạnh. Các exon của gen được khuếch đại bằng 29 cặp mồi, sản phẩm PCR sau đó được giải trình tự bằng máy tự động. Kết quả được phân tích bằng phần mềm chuyên dụng. | Nghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Tập 18 * Số 4 * 2014 XÂY DỰNG QUY TRÌNH KHUẾCH ĐẠI VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN APC Đoàn Nam Khánh*, Nguyễn Ngọc Minh**, Lê Minh Khôi**, Nguyễn Trung Tín**, Đỗ Thị Thanh Thủy**, Lê Thị Hương Lan***, Nguyễn Thị Băng Sương** TÓM TẮT Giới thiệu: Gen APC (adenomatous polyposis coli gene) là một gen ức chế khối u gồm 15 exon nằm tại vị trí 5q21‐q22, sản phẩm dịch mã của gen là protein APC dài 2843 acid amin. Protein APC với vai trò chính là cô lập các hiệu ứng kích thích tăng trưởng của Beta‐catenin nhằm thúc đẩy sự chết theo chương trình của tế bào. Người mang gen APC bị đột biến sẽ dẫn đến một số bệnh liên quan như bệnh đa polyp đại trực tràng, bệnh ung thư hệ tiêu hóa, các tuyến, các cơ quan (não, gan, tuyến thượng thận, tuyến tụy, tuyến giáp, ) và một số bệnh bẩm sinh khác. Mục tiêu: Xây dựng quy trình khuếch đại toàn bộ 15 exon của gen APC bằng phản ứng PCR và giải trình tự gen APC. Đối tượng và phương pháp: DNA được tách chiết từ máu ngoại vi của 15 người khỏe mạnh. Các exon của gen được khuếch đại bằng 29 cặp mồi, sản phẩm PCR sau đó được giải trình tự bằng máy tự động. Kết quả được phân tích bằng phần mềm chuyên dụng. Kết quả: Xây dựng thành công quy trình PCR khuếch đại 15 exon của gen APC với nhiệt độ bắt cặp tối ưu là 59 C, độ nhạy của quy trình là 1 ng/ μL. Sản phẩm giải trình tự cho kết quả tương đồng với trình tự gen APC chuẩn trên NCBI. o Kết luận: Xây dựng thành công quy trình khuếch đại và giải trình tự toàn bộ gen APC. Từ khóa: gen APC, khuếch đại gen, quy trình giải trình tự. ABSTRACT ESTABLISH PROTOCOL FOR AMPLIFICATION AND SEQUENCING APC GENE Doan Nam Khanh, Nguyen Ngoc Minh, Le Minh Khoi, Nguyen Trung Tin, Do Thi Thanh Thuy, Le Thi Huong Lan, Nguyen Thi Bang Suong * Y Hoc TP. Ho Chi Minh * Vol. 18 ‐ No 4 ‐ 2014: 100 ‐ 106 Introduction: APC (adenomatous polyposis coli) is a tumor suppressor gene. It contains 15 exons locating at 5q21‐q22. The 2843 amino‐acid APC protein .
đang nạp các trang xem trước
