TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Research Article Identifying Genes Involved in Cyclic Processes by Combining Gene Expression Analysis and Prior Knowledge"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành hóa học dành cho các bạn yêu hóa học tham khảo đề tài: Research Article Identifying Genes Involved in Cyclic Processes by Combining Gene Expression Analysis and Prior Knowledge | Hindawi Publishing Corporation EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology Volume 2009 Article ID 683463 9 pages doi 2009 683463 Research Article Identifying Genes Involved in Cyclic Processes by Combining Gene Expression Analysis and Prior Knowledge Wentao Zhao 1 Erchin Serpedin EURASIP Member 1 and Edward R. Dougherty1 2 1 Department of Electrical and Computer Engineering Texas A M University College Station TX 77843-3128 USA 2 Computational Biology Division Translational Genomics Research Institute 400 North Fifth Street Suite 1600 Phoenix AZ 85004 UsA Correspondence should be addressed to Erchin Serpedin serpedin@ Received 9 July 2008 Revised 24 December 2008 Accepted 26 January 2009 Recommended by Yufei Huang Based on time series gene expressions cyclic genes can be recognized via spectral analysis and statistical periodicity detection tests. These cyclic genes are usually associated with cyclic biological processes for example cell cycle and circadian rhythm. The power of a scheme is practically measured by comparing the detected periodically expressed genes with experimentally verified genes participating in a cyclic process. However in the above mentioned procedure the valuable prior knowledge only serves as an evaluation benchmark and it is not fully exploited in the implementation of the algorithm. In addition partial data sets are also disregarded due to their nonstationarity. This paper proposes a novel algorithm to identify cyclic-process-involved genes by integrating the prior knowledge with the gene expression analysis. The proposed algorithm is applied on data sets corresponding to Saccharomyces cerevisiae and Drosophila melanogaster respectively. Biological evidences are found to validate the roles of the discovered genes in cell cycle and circadian rhythm. Dendrograms are presented to cluster the identified genes and to reveal expression patterns. It is corroborated that the proposed novel identification scheme .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.