TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates | Ali et al. Virology Journal 2010 7 111 http content 7 1 111 VIROLOGY JOURNAL SHORT REPORT Open Access Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates Maisa M All 1 4 Fuad Hasan2 3 4 Suhail Ahmad1 4 and Widad Al-Nakib1 4 Abstract Genotypes A to H of hepatitis B virus HBV influence liver disease progression and response to antiviral therapy in HBV-infected patients. Several methods have been developed for rapid genotyping of HBV strains. However some of these methods may not be suitable for developing countries. The performance of INNO-LiPA HBV Genotyping assay LiPA direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP of genotype-specific HBV genome regions were evaluated for accurately determining the HBV genotypes by analyzing sera n 80 samples from chronic HBV patients. Both LiPA and DNA sequencing identified 63 4 and 13 HBV strains as belonging to genotype D genotype A and mixed genotype A and D respectively. On the contrary the PCR-RFLP-based method correctly identified all 4 genotype A but only 56 of 63 genotype D strains. Seven genotype D strains yielded indeterminate results. DNA sequence comparisons showed that a single nucleotide change in the target region generated an additional restriction site for Nla IV that compromised the accuracy of this method. Furthermore all the mixed genotype A and D strains were identified only as genotype A strains. The data show that the PCR-RFLP-based method incorrectly identified some genotype D strains and failed to identify mixed genotype infections while LiPA and DNA sequencing yielded accurate results. Findings Eight distinct genotypes A to H of hepatitis B virus HBV have been identified and their occurrence exhibits distinct preferences for ethnic origin of the patient and or geographic regions of the world 1 2 . Recent studies have shown that HBV genotypes influence liver disease progression selection of mutants and .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.