TAILIEUCHUNG - Phân tích trình tự gen mã hoá polyhedrin của momodon baculovirus (MBV) gây bệnh trên tôm sú (Penaeus monodon) Việt Nam
Baculovirus là virus gây bệnh trên tôm nuôi, có cấu trúc di truyền ở dạng DNA xoắn kép, kích thước bộ gen bp, virion ở trạng thái tự do hoặc bao bọc bởi vỏ capsid vùi trong thể ẩn (OBs). Thế ẩn được câu trúc bởi chất mền polyhedrin, chúng bảo vệ cho virus tồn tại được bên ngoài môi trường cho đến khi virus chui vào ấu trùng của tôm. Polyhedrin là một loại protein có kích thước 17 đến 23 nm đồng thời là kháng nguyên bề mặt quyết định cho việc chẩn đoán Baculovirus. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 15(1): 55-61, 2017 PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN MÃ HOÁ POLYHEDRIN CỦA MOMODON BACULOVIRUS (MBV) GÂY BỆNH TRÊN TÔM SÚ (PENAEUS MONODON) VIỆT NAM Nguyễn Thị Giang An1, *, Đồng Văn Quyền2, Đinh Duy Kháng2 1 2 Viện Sư phạm tự nhiên, Trường Đại học Vinh Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam * Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail: nguyengiangan@ Ngày nhận bài: Ngày đăng bài: TÓM TẮT Baculovirus là virus gây bệnh trên tôm nuôi, có cấu trúc di truyền ở dạng DNA xoắn kép, kích thước bộ gen bp, virion ở trạng thái tự do hoặc bao bọc bởi vỏ capsid vùi trong thể ẩn (OBs). Thế ẩn được câu trúc bởi chất mền polyhedrin, chúng bảo vệ cho virus tồn tại được bên ngoài môi trường cho đến khi virus chui vào ấu trùng của tôm. Polyhedrin là một loại protein có kích thước 17 đến 23 nm đồng thời là kháng nguyên bề mặt quyết định cho việc chẩn đoán tích trình tự gen mã hóa polyhedrin (polhed) cho thấy khung đọc mở (ORF) của chúng dài bp, mã hóa cho protein gồm 457 amino acid. So sánh với trình tự nucleotide của polyhedrin công bố trên GenBank cho thấy, tính tương đồng của gen polhed phân lập tại Việt Nam với Thái lan, Đài Loan và Ấn Độ có sự tương đồng lần lượt là 97%, 97% và 94%. Phân tích sâu hơn ở mức độ protein, tại đầu N của polyhedrin ở Việt Nam có sự sai khác lớn so với polyhedrin phân lập ở Thái Lan. Đặc biệt là tại vị trí amino acid (aa) 72-73 có chèn thêm 4 aa (NEPM) và vị trí amino acid 81-82 chèn thêm 7 aa (PYHNSPN) mà polyhedrin từ Thái Lan không có. Ngoài ra tại một số vị trí khác cũng có sự biến đổi như: , , , , , và đáng chú ý, đoạn trình tự này đã được khẳng định là điểm quyết định kháng nguyên. Vì vậy, nến sử dụng các kít nhập ngoại cho việc chẩn đoán MBV sẽ có độ đặc hiệu không cao. Kết quả nghiên cứu cho thấy, chủng virus MBV gây bệnh trên tôm sú ở Việt Nam đã có sự biến đổi
đang nạp các trang xem trước
