TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Nucleotide mismatches between the VP7 gene and the primer are associated with genotyping failure of a specific lineage from G1 rotavirus strains"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành hóa học dành cho các bạn yêu hóa học tham khảo đề tài: Nucleotide mismatches between the VP7 gene and the primer are associated with genotyping failure of a specific lineage from G1 rotavirus strains | Virology Journal BioMed Central Short report Open Access Nucleotide mismatches between the VP7 gene and the primer are associated with genotyping failure of a specific lineage from Gl rotavirus strains Gabriel I Parra and Emilio E Espinola Address Departamento de Biología Molecular Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud Universidad Nacional de Asuncion. Río de la Plata y Lagerenza Asunción 2511 Paraguay Email Gabriel I Parra - gabriel_parra@ Emilio E Espinola - emilioespinola@ Corresponding author Published 25 May 2006 Received 04 January 2006 Accepted 25 May 2006 Virology Journal 2006 3 35 doi 186 1743-422X-3-35 This article is available from http content 3 1 35 2006 Parra and Espinola licensee BioMed Central Ltd. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract In recent years it was reported that the accumulation of point mutations in VP4 and VP7 genes of rotavirus strains was the main cause of the failure of the G or P-typing. Failures in the correct genotyping of G1 G2 G8 G9 and GI0 rotavirus strains were reported in the most commonly used reverse transcription RT -PCR strategies. Collecting VP7 gene sequences of G1 rotavirus strains from databases we found that 74 out of 121 G1 strains from lineage I showed the four specific mismatches at the 5 end of the 9T1-1 primer previously associated with the failure of G1-typing. Thus a great percentage of the G1 strains from lineage I worldwide reported could not have been typed if the Das s RT-PCR strategy were used. This analysis shows that the failure on the detection of the G1 strains could be due to the diversification of rotavirus strains in phylogenetic lineages. Therefore the use of different RT-PCR strategies with different .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.