TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Phylogenetic analyses of the polyprotein coding sequences of serotype O foot-and-mouth disease viruses in East Africa: evidence for interserotypic recombination"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Phylogenetic analyses of the polyprotein coding sequences of serotype O foot-and-mouth disease viruses in East Africa: evidence for interserotypic recombination | Balinda et al. Virology Journal 2010 7 199 http content 7 1 199 VIROLOGY JOURNAL RESEARCH Open Access Phylogenetic analyses of the polyprotein coding sequences of serotype O foot-and-mouth disease viruses in East Africa evidence for interserotypic recombination 1 2 1 1 Sheila N Balinda Hans R Siegismund Vincent B Muwanika Abraham K Sangula Charles Masembe Chrisostom Ayebazibwe4 Preben Normann3 Graham J Belsham3 Abstract Background Foot-and-mouth disease FMD is endemic in East Africa with the majority of the reported outbreaks attributed to serotype O virus. In this study phylogenetic analyses of the polyprotein coding region of serotype O FMD viruses from Kenya and Uganda has been undertaken to infer evolutionary relationships and processes responsible for the generation and maintenance of diversity within this serotype. FMD virus RNA was obtained from six samples following virus isolation in cell culture and in one case by direct extraction from an oropharyngeal sample. Following RT-PCR the single long open reading frame encoding the polyprotein was sequenced. Results Phylogenetic comparisons of the VP1 coding region showed that the recent East African viruses belong to one lineage within the EA-2 topotype while an older Kenyan strain K 52 1992 is a representative of the topotype EA-1. Evolutionary relationships between the coding regions for the leader protease L the capsid region and almost the entire coding region are monophyletic except for the K 52 1992 which is distinct. Furthermore phylogenetic relationships for the P2 and P3 regions suggest that the K 52 1992 is a probable recombinant between serotypes A and O. A bootscan analysis of K 52 1992 with East African FMD serotype A viruses A21 KEN 1964 and A23 KEN 1965 and serotype O viral isolate K 117 1999 revealed that the P2 region is probably derived from a serotype A strain while the P3 region appears to be a mosaic derived from both serotypes A and O. Conclusions Sequences of the VP1

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.