TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Development of a real-time quantitative PCR assay for detection of a stable genomic region of BK virus"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Development of a real-time quantitative PCR assay for detection of a stable genomic region of BK virus | Iwaki et al. Virology Journal 2010 7 295 http content 7 1 295 VIROLOGY JOURNAL METHODOLOGY Open Access Development of a real-time quantitative PCR assay for detection of a stable genomic region of BK virus 1 1l Z 1 -7 1 1 1 Kosuke K Iwaki Suhail H Qazi Jean Garcia-Gomez Deanna Zeng Yasuhiio Matsuda Kazuko Matsuda l nnỈ p K l rtino 1 I Iicil r 1 Tmx rnH 2 Art ll IZr tro3 A oclo T Cfox onc4 KAir cl tA Cmr tr ir ir zotA cIzi5 Monica E Maitinez Mieko Toyoda Aiputnaiaj Koie Wesley T Stevens Miioslaw Smogoizewski Daisuke D Iwaki1 Yasii Qazi5 Yuichi Iwaki1 Abstract Background BK viius infections can have clinically significant consequences in immunocompromised individuals. Detection and monitoring of active BK viius infections in certain situations is recommended and therefore PCR assays foi detection of BK viius have been developed. The peifoimance of cuiient BK PCR detection assays is limited by the existence of viral polymoiphisms unknown at the time of assay development resulting in inconsistent detection of BK viius. The objective of this study was to identify a stable region of the BK viial genome foi detection by PCR that would be minimally affected by polymoiphisms as moie sequence data foi BK viius becomes available. Results Employing a combination of techniques including amino acid and DNA sequence alignment and inteispecies analysis a conseived stable PCR taiget iegion of the BK viial genomic iegion was identified within the VP2 gene. A ieal-time quantitative PCR assay was then developed that is specific foi BK viius has an analytical sensitivity of 15 copies ieaction 450 copies ml and is highly reproducible CV . Conclusion Identifying stable PCR taiget regions when limited DNA sequence data is available may be possible by combining multiple analysis techniques to elucidate potential functional constraints on genomic regions. Applying this approach to the development of a ieal-time quantitative PCR assay foi BK viius resulted in an .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.