Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Nông - Lâm - Ngư
Nông nghiệp
Transcriptome analysis of banana (Musa balbisiana) based on next-generation sequencing technology
TAILIEUCHUNG - Transcriptome analysis of banana (Musa balbisiana) based on next-generation sequencing technology
Banana (Musa spp.) is an important tropical fruit with high commercial potential. Musa balbisiana (B genome) is a progenitor of one of the most cultivated banana species and exhibits unique traits, including resistance or tolerance to many biotic and abiotic stresses. | Turkish Journal of Agriculture and Forestry Research Article Turk J Agric For (2015) 39: 705-717 © TÜBİTAK doi: Transcriptome analysis of banana (Musa balbisiana) based on next-generation sequencing technology Suthanthiram BACKIYARANI*, Subbaraya UMA, Marimuthu Somasundram SARASWATHI, Asoor Santhanam SARAVANAKUMAR, Arumugam CHANDRASEKAR ICAR-National Research Centre for Banana, Triuchirapalli, Tamil Nadu, India Received: Accepted/Published Online: Printed: Abstract: Banana (Musa spp.) is an important tropical fruit with high commercial potential. Musa balbisiana (B genome) is a progenitor of one of the most cultivated banana species and exhibits unique traits, including resistance or tolerance to many biotic and abiotic stresses. RNA sequencing of the Musa B genome would provide a vast array of transcriptomic information that could lead to the development of trait-specific markers and the discovery of new genes and regulatory sequences involved in resistance mechanisms. Thus, transcriptome sequencing was performed in Musa B genome accession Attikol using the Ion Torrent platform. This led to the generation of about million paired-end reads, which were assembled using the MIRA assembler. The assembly produced 82,413 unique transcripts with a mean length of approximately 113 bp. The sequence similarity search against the Swiss-Prot database resulted in the identification of 35,783 unique transcripts (). Out of these, 193,826 gene ontology terms were assigned to unique transcripts. Functional annotation against PlantCYC pathway database identified 20,696 unique transcripts, which were mapped to 455 pathways. About 4780 simple sequence repeats (SSRs) were obtained from 82,413 unique transcripts. Primers could be designed for only 2628 SSRs, out of which 30 primers were randomly selected from defense-related genes to confirm their efficiency. This information
Ðức Toản
97
13
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Linkage analysis, GWAS, transcriptome analysis to identify candidate genes for rice seedlings in response to high temperature stress
13
34
1
Comparative transcriptome analysis indicates that a core transcriptional network mediates isonuclear alloplasmic male sterility in wheat (Triticum aestivum L.)
19
96
0
Integrative testis transcriptome analysis reveals differentially expressed miRNAs and their mRNA targets during early puberty in Atlantic salmon
12
48
1
Study on cyanidin metabolism in petals of pink-flowered strawberry based on transcriptome sequencing and metabolite analysis
16
51
0
Annotation of genes involved in high level of dihydromyricetin production in vine tea (Ampelopsis grossedentata) by transcriptome analysis
12
84
0
Integrated analysis of the proteome and transcriptome in a MCAO mouse model revealed the molecular landscape during stroke progression
15
77
0
Oil biosynthesis in a basal angiosperm: transcriptome analysis of Persea Americana mesocarp
19
69
0
Full-length transcriptome analysis of Phytolacca americana and its congener P. icosandra and gene expression normalization in three Phytolaccaceae species
13
26
1
Comparative transcriptome profiling and co-expression network analysis uncover the key genes associated withearly-stage resistance to Aspergillus flavus in maize
18
35
1
GCSscore: An R package for differential gene expression analysis in Affymetrix/ Thermo-Fisher whole transcriptome microarrays
12
28
1
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461834
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22491
57
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10844
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10022
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9476
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8236
1124
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8196
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7856
2219
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6634
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5749
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Nông nghiệp
Transcriptome analysis of banana
Ion Torrent
Musa balbisiana
Next generation sequencing
Next generation sequencing technology
BMC Plant Biology
Fruit ripening
Musa acuminata
Transcriptome analysis
Unripe fruit tissue
Banana identifies
Metabolic networks
BMC Genomics
Fusarium wilt
Resistance inducers
Plant phytohormones
Cell wall modification
BMC Genetics
Banana Fusarium
Fusarium oxysporum f sp cubense
RNA seq
Resistance differences
Pathogenic molecular mechanism
BMC Bioinformatics
Quality control
Adapter removing
Downstream analyses
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Giáo án mầm non chương trình đổi mới: Đề tài: Ôn xác định vị trí trên – dưới, trước- sau của đối tượng khác.
8
347
3
18-04-2024
CẤU TẠO HẠT NHÂN NGUYÊN TỬ-ĐỘ HỤT KHỐI-NĂNG LƯỢNG LIÊN KẾT-LK RIÊNG
12
262
0
18-04-2024
Sẵn sàng cho thảm họa
9
219
0
18-04-2024
extremetech Hacking Firefox phần 7
46
185
0
18-04-2024
Trading Strategies Profit Making Techniques For Stock_8
23
170
0
18-04-2024
Management and Services Part 1
10
155
0
18-04-2024
MySQL Database Usage & Administration PHẦN 7
37
154
0
18-04-2024
BÀI GIẢNG VỀ - MẠCH ĐIỆN II - Chương I: Phân tích mạch trong miền thời gian
38
140
0
18-04-2024
B2B Content Marketing: 2012 Benchmarks, Budgets & Trends
17
137
0
18-04-2024
Lịch sử Đội TNTP Hồ Chí Minh - CHƯƠNG III VÂNG LỜI BÁC DẠY, LÀM NGHÌN VIỆC TỐT, CHỐNG MỸ, CỨU NƯỚC, THIẾU NIÊN SĂN SÀNG
45
136
0
18-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7856
2219
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5571
1319
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3739
1228
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8236
1124
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5232
1124
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3467
641
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10844
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3665
524
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4012
513
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4090
478
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.