TAILIEUCHUNG - Đánh giá tính đa dạng di truyền của baculovirus gây nhiễm sâu hại trên rau ở một số khu vực miền Nam Việt Nam
Trong nghiên cứu này, chúng tôi sử dụng gene lef-8, là gene đặc trưng cho baculovirus, để đánh giá độ đa dạng di truyền cũng như mối quan hệ phát sinh loài của một số nhóm baculovirus ở khu vực miền Nam Việt Nam và một số nhóm khác trên thế giới. | TẠP CHÍ SINH HỌC 2013, 35(4): 424-428 ĐÁNH GIÁ TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA BACULOVIRUS GÂY NHIỄM SÂU HẠI TRÊN RAU Ở MỘT SỐ KHU VỰC MIỀN NAM VIỆT NAM Nguyễn Thị Phương Thảo1*, Lê Thành Long1, Văn Thị Hạnh1, Nguyễn Thị Hồng Vân1, Nguyễn Khắc Duy2 1 Viện Sinh học nhiệt đới, Viện Hàn lâm KH & CN Việt Nam, *bbgthao@ 2 Trường Đại học Quốc tế, Đại học Quốc gia Tp. Hồ Chí Minh TÓM TẮT: Phương pháp PCR được sử dụng để khuếch đại gene lef-8 đặc trưng cho baculovirus. Trình tự gene lef-8 được sử dụng để đánh giá tính đa dạng di truyền và mối quan hệ phát sinh loài của một số nhóm baculovirus của khu vực miền Nam Việt Nam và một số nhóm baculovirus khác trên thế giới. Kết quả nghiên cứu của chúng tôi cho thấy, nhóm baculovirus khu vực miền Nam Việt Nam và nhóm Alpha-2 baculovirus có khoảng cách di truyền nhỏ, điều đó chứng tỏ nhóm baculovirus khu vực miền Nam Việt Nam có mối quan hệ di truyền gần gũi với nhóm Alpha-2 baculovirus (0,346±0,069). Việc phân tích mối quan hệ phát sinh loài củng cố cho kết qua phân tích khoảng cách di truyền trên, các nhóm baculovirus của khu vực miền Nam Việt Nam có sự phân bố chung với nhóm Alpha-2 baculovirus với giá trị bootstrap 86% cụ thể là spodoptera_lutira_NPV. Các kết quả trên chứng tỏ nhóm spodoptera_lutira_NPV có sự phân bố rộng ở khu vực miền Nam Việt Nam. Từ khóa: Baculovirus, DNA bộ gene, gene lef-8, khoảng cách di truyền, quan hệ phát sinh loài. MỞ ĐẦU Baculovirus là nhóm virus có vỏ bao, đặc trưng cho nhóm động vật chân đốt, chúng có bộ gene DNA dạng vòng mạch kép và có thể tự nhân lên trong tế bào chủ [3]. Hiện nay, có hơn 600 loài baculovirus được mô tả ở các bộ khác nhau như Lepidoptera, Diptera và Hymenoptera, trong đó, hơn 90% baculovirus được phân lập từ các loài thuộc bộ Lepidoptera [6]. Họ baculovirus được chia thành 4 nhóm khác nhau dựa trên các đặc tín cấu trúc và chức năng: Alphabaculovirus, bao gồm các baculoviruses đặc hiệu cho Lepidoptera, được chia thành 2 nhóm là nhóm I và nhóm II dựa vào loại protein .
đang nạp các trang xem trước
