TAILIEUCHUNG - Báo cáo khoa học: "Complete genome sequence of human astrovirus genotype 6"

Complete genome sequence of human astrovirus genotype 6 | Guo et al. Virology Journal 2010 7 29 http content 7 1 29 VIROLOGY JOURNAL RESEARCH Open Access Complete genome sequence of human astrovirus genotype 6 Li Guo 1 Richard Gonzalez1 2 Wei Wang1 Yongjun Li1 2 Gláucia Paranhos-Baccalà2 Guy Vernet2 Jianwei Wang1 Abstract Background Human astroviruses HAstVs are one of the important causes of acute gastroenteritis in children. Currently eight HAstV genotypes have been identified and all but two HAstV-6 and HAstV-7 have been fully sequenced. We here sequenced and analyzed the complete genome of a HAstV-6 strain 192-BJ07 which was identified in Beijing China. Results The genome of 192-BJ07 consists of 6745 nucleotides. The 192-BJ07 strain displays a nucleotide sequence identity with other HAstV genotypes and exhibits amino acid sequence identities of and in the ORF1a ORF1b and ORF2 regions respectively. Homological analysis of ORF2 shows that 192-BJ07 is identical to the documented HAstV-6 strain. Further phylogenetic analysis indicates that different genomic regions are likely undergoing different evolutionary and selective pressures. No recombination event was observed in HAstV-6 in this study. Conclusion The completely sequenced and characterized genome of HAstV-6 192-BJ07 provides further insight into the genetics of astroviruses and aids in the surveillance and control of HAstV gastroenteritis. Background Human astroviruses HAstVs are one of the most common causes of acute gastroenteritis in children worldwide 1-3 . HAstV was first identified during an outbreak of gastroenteritis among hospitalized infants in 1975 4 . Its name is derived from its distinctive starshaped appearance under the electron microscopy EM . Molecular analyses indicate that HAstVs are non-envel-oped viruses with a 6-8 kb single-stranded positivesense RNA genome consisting of three overlapping open reading frames ORFs -ORF1a ORF1b and ORF2-as well as the 5 - and 3 nontranslated regions

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.