Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học: "Hierarchical folding of multiple sequence alignments for the prediction of structures and RNA-RNA interactions"
TAILIEUCHUNG - Báo cáo sinh học: "Hierarchical folding of multiple sequence alignments for the prediction of structures and RNA-RNA interactions"
Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về sinh học được đăng trên tạp chí y học Molecular Biology cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành sinh học đề tài: Hierarchical folding of multiple sequence alignments for the prediction of structures and RNA-RNA interactions. | Seemann et al. Algorithms for Molecular Biology 2010 5 22 http content 5 1 22 AMR ALGORITHMS FOR ID MOLECULAR BIOLOGY RESEARCH Open Access Hierarchical folding of multiple sequence alignments for the prediction of structures and RNA-RNA interactions Stefan E Seemann21 Andreas S Richter22 Jan Gorodkin1 and Rolf Backofen 2 Abstract Background Many regulatory non-coding RNAs ncRNAs function through complementary binding with mRNAs or other ncRNAs microRNAs snoRNAs and bacterial sRNAs. Predicting these RNA interactions is essential for functional studies of putative ncRNAs or for the design of artificial RNAs. Many ncRNAs show clear signs of undergoing compensating base changes over evolutionary time. Here we postulate that a non-negligible part of the existing RNA-RNA interactions contain preserved but covarying patterns of interactions. Methods We present a novel method that takes compensating base changes across the binding sites into account. The algorithm works in two steps on two pre-generated multiple alignments. In the first step individual base pairs with high reliability are found using the PETfold algorithm which includes evolutionary and thermodynamic properties. In step two where high reliability base pairs from step one are constrained as unpaired the principle of cofolding is combined with hierarchical folding. The final prediction of intra- and inter-molecular base pairs consists of the reliabilities computed from the constrained expected accuracy scoring which is an extended version of that used for individual multiple alignments. Results We derived a rather extensive algorithm. One of the advantages of our approach in contrast to other RNA-RNA interaction prediction methods is the application of covariance detection and prediction of pseudoknots between intra- and inter-molecular base pairs. As a proof of concept we show an example and discuss the strengths and weaknesses of the approach. Background Predicting RNA-RNA interactions is
Nguyên Bảo
71
13
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo sinh học: " Research Article Levitin-Polyak Well-Posedness in Vector Quasivariational Inequality Problems with Functional Constraints"
16
95
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Stabilities of Cubic Mappings in Fuzzy Normed Spaces"
15
105
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Inequalities among Eigenvalues of Second-Order Symmetric Equations on Time Scales"
24
94
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Explicit Conditions for Stability of Nonlinear Scalar Delay Impulsive Difference Equation Bo Zheng"
17
100
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Existence and Uniqueness of Mild Solution for Fractional Integrodifferential Equations"
10
92
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Solutions of Linear Impulsive Differential Systems Bounded on the Entire Real Axis"
10
88
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Asymptotical Behaviors of Nonautonomous Discrete Kolmogorov System with Time Lags"
19
97
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Boundary Value Problems for Delay Differential Systems"
20
91
0
Báo cáo sinh học: "Research Article Monotone Iterative Technique for First-Order Nonlinear Periodic Boundary Value Problems on Time Scales"
10
99
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Symmetric Three-Term Recurrence Equations and Their Symplectic Structure"
17
103
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461949
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
23135
64
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10989
531
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10186
451
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9572
106
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8396
1136
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8278
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7896
2234
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6839
256
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
6141
1488
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học hay
cách trình bày báo cáo
báo cáo sinh học
công trình nghiên cứu sinh học
tài liệu về sinh học
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Động cơ đốt trong và máy kéo công nghiêp tập 1 part 7
23
268
0
22-05-2024
extremetech Hacking BlackBerry phần 9
31
264
0
22-05-2024
TƯƠNG QUAN GIỮA MÔ HỌC, GIẢI PHẪU VÀ HÌNH ẢNH CỦA CÁC KHỐI U PHẦN PHỤ
3
175
0
22-05-2024
THE ANTHROPOLOGY OF ONLINE COMMUNITIES BY Samuel M.Wilson and Leighton C. Peterson
19
161
0
22-05-2024
B2B Content Marketing: 2012 Benchmarks, Budgets & Trends
17
147
0
22-05-2024
QUẢN LÝ CHẤT LƯỢNG KHÔNG KHÍ
75
145
0
22-05-2024
HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG PHẦN MỀM CAITA part 9
18
137
0
22-05-2024
Christmas Meditations on the Twelve Holy Days
173
112
0
22-05-2024
Lãi suất cơ bản, công cụ quan trọng của chính sách tiền tệ
5
120
0
22-05-2024
Fecal Incontinence Diagnosis and Treatment - part 8
35
111
0
22-05-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7896
2234
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
6141
1488
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3789
1255
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5426
1140
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8396
1136
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3552
656
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3759
544
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10989
531
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4172
523
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4192
483
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.