TAILIEUCHUNG - báo cáo khoa học: " From RNA-seq to large-scale genotyping genomics resources for rye (Secale cereale L.)"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: From RNA-seq to large-scale genotyping genomics resources for rye (Secale cereale L.) | Haseneyer et al. BMC Plant Biology 2011 11 131 http 1471 -2229 11 131 BMC Plant Biology RESEARCH ARTICLE Open Access From RNA-seq to large-scale genotyping -genomics resources for rye Secale cereale L. zi I_I rrtrí 1 4 I I c I I r2 4 MiekG C I 4 ze 13 rr I I z-y z- 7 I I I4 r 1 ì 2 r I y I r xrrx lì c r I z ýỳ yz 1 Grit Haseneyer Thomas Schmutzer Michael Seidel Ruonan Zhou Martin Mascher cnris-caronn Schon n Tn lelZie4 I I . o Ce-br i l 72 Mile toile4 l lt IC P 1. 111O14 nee -1111 Re ef Stefan Taudien Uwe Scholz Nils Stein Klaus FX Mayer and Eva Bauer Abstract Background The improvement of agricultural crops with regard to yield resistance and environmental adaptation is a perpetual challenge for both breeding and research. Exploration of the genetic potential and implementation of genome-based breeding strategies for efficient rye Secale cereale L. cultivar improvement have been hampered by the lack of genome sequence information. To overcome this limitation we sequenced the transcriptomes of five winter rye inbred lines using Roche 454 GS FLX technology. Results More than million reads were assembled into 115 400 contigs representing a comprehensive rye expressed sequence tag EST resource. From sequence comparisons 5 234 single nucleotide polymorphisms SNPs were identified to develop the Rye5K high-throughput SNP genotyping array. Performance of the Rye5K SNP array was investigated by genotyping 59 rye inbred lines including the five lines used for sequencing and five barley three wheat and two triticale accessions. A balanced distribution of allele frequencies ranging from to was observed. Residual heterozygosity of the rye inbred lines varied from to with higher average heterozygosity in the pollen compared to the seed parent pool. Conclusions The established sequence and molecular marker resources will improve and promote genetic and genomic research as well as genome-based breeding in rye. Keywords EST .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.