TAILIEUCHUNG - báo cáo khoa học: " Development of genic-SSR markers by deep transcriptome sequencing in pigeonpea [Cajanus cajan (L.) Millspaugh]"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Development of genic-SSR markers by deep transcriptome sequencing in pigeonpea [Cajanus cajan (L.) Millspaugh] | Dutta et al. BMC Plant Biology 2011 11 17 http 1471-2229 11 17 BMC Plant Biology RESEARCH ARTICLE Open Access Development of genic-SSR markers by deep transcriptome sequencing in pigeonpea Cajanus cajan L. Millspaugh f .1 1 1 1 1 Sutapa Dutta Giriraj Kumawat Bikram P Singh Deepak K Gupta Sangeeta Singh Vivek Dogra 1 1 Z X3 2 - 4 5 Kishor Gaikwad Tilak R Sharma Ranjeet S Raje Tapas K Bandhopadhya Subhojit Datta Mahendra N Singh Fakrudin Bashasab6 Pawan Kulwal7 KB Wanjari7 Rajeev K Varshney8 Douglas R Cook9 Nagendra K Singh1 Abstract Background Pigeonpea Cajanus cajan L. Millspaugh one of the most important food legumes of semi-arid tropical and subtropical regions has limited genomic resources particularly expressed sequence based genic markers. We report a comprehensive set of validated genic simple sequence repeat SSR markers using deep transcriptome sequencing and its application in genetic diversity analysis and mapping. Results In this study 43 324 transcriptome shotgun assembly unigene contigs were assembled from million 454 GS-FLX sequence reads of separate pooled cDNA libraries prepared from leaf root stem and immature seed of two pigeonpea varieties Asha and UPAS 120. A total of 3 771 genic-SSR loci excluding homopolymeric and compound repeats were identified of which 2 877 PCR primer pairs were designed for marker development. Dinucleotide was the most common repeat motif with a frequency of followed by tri- hexa- tetra- and pentanucleotide repeat motifs. Primers were synthesized and tested for 772 of these loci with repeat lengths of 18 bp. Of these 550 markers were validated for consistent amplification in eight diverse pigeonpea varieties 71 were found to be polymorphic on agarose gel electrophoresis. Genetic diversity analysis was done on 22 pigeonpea varieties and eight wild species using 20 highly polymorphic genic-SSR markers. The number of alleles at these loci ranged from 4-10 and the .

Thiên Ân 71 13 pdf

Upload

Bấm vào đây để xem trước nội dung

Tải xuống

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

Báo cáo khoa học: " Áp dụng thủ tục phân tích trong kiểm toán báo cáo tài chính"

8 256 1

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Người lính trở về sau chiến tranh với mặc cảm “ăn mày dĩ vãng’ trong tiểu thuyết Chu Lai"

8 302 1

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Khảo sát hiện tượng chuyển đổi chức năng - nghĩa của động từ tiếng Việt"

8 235 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Tính năng động nghệ thuật của văn học hiện đại Việt Nam và một cách nhìn hành trình thể loại"

10 206 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: " Dẫn liệu cập nhật về thành phần loài cây họ đậu (Fabaceae) tại Vườn Quốc gia Bạch Mã - Thừa Thiên Huế "

6 206 1

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Một số kết quả của việc bổ sung bột sắn vào khẩu phần ăn và khả năng tiêu hóa thức ăn, hiệu quả chăn nuôi ở bò Laisind"

8 238 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Nghiên cứu mật độ và thành phần thức ăn của một số loài ếch nhái trên đồng ruộng Sầm Sơn - Thanh Hoá"

6 210 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Một số phép toán trên hệ biểu diễn tri thức dựa theo triết lý tập thô.."

7 212 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: " Liên hệ giữa không gian metric mờ với không gian Menger và không gian metric xác suất"

10 211 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: " BẢN CHẤT KHOA HỌC VÀ CÁCH MẠNG LÀ CỘI NGUỒN SỨC SỐNG CỦA CHỦ NGHĨA MÁC - LÊNIN"

5 298 1

TÀI LIỆU XEM NHIỀU

Một Case Về Hematology (1)

8 461860 55

Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở

14 22613 59

Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh

13 10883 529

Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học

14 10060 446

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”

3 9515 104

Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)

249 8274 1125

Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức

16 8225 423

Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB

8 7863 2220

Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ

17 6669 253

Vật lý hạt cơ bản (1)

29 5767 85

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG

Mass Transfer in Multiphase Systems and its Applications Part 19

40 255 1 25-04-2024

extremetech Hacking Firefox phần 7

46 187 0 25-04-2024

Management and Services Part 1

10 156 0 25-04-2024

MySQL Database Usage & Administration PHẦN 7

37 154 0 25-04-2024

The profit magic of stock Timing The Markets_5

22 119 0 25-04-2024

Đóng mới oto 8 chỗ ngồi part 9

10 116 0 25-04-2024

Khurana et al. Journal of Orthopaedic Surgery and Research 2010, 5:23

7 133 0 25-04-2024

Giáo trình tổng quan khoa học thông tin và thư viện part 7

22 143 2 25-04-2024

Christmas Meditations on the Twelve Holy Days

173 103 0 25-04-2024

báo cáo hóa học:" Increased androgen receptor expression in serous carcinoma of the ovary is associated with an improved survival"

6 99 0 25-04-2024

TÀI LIỆU HOT

Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB

8 7863 2220

Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)

152 5695 1353

Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng

112 3764 1231

Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1

62 5311 1135

Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)

249 8274 1125

Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu

561 3492 642

Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh

13 10883 529

Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân

122 3679 525

Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm

274 4041 514

Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe

35 4123 480