TAILIEUCHUNG - Báo cáo hóa học: " Unscented Kalman filter with parameter identifiability analysis for the estimation of multiple parameters in kinetic models"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về hóa học được đăng trên tạp chí sinh học đề tài :Unscented Kalman filter with parameter identifiability analysis for the estimation of multiple parameters in kinetic models | Baker et al. EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology 2011 2011 7 http content 2011 1 7 s EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology a SpringerOpen Journal RESEARCH Open Access Unscented Kalman filter with parameter identifiability analysis for the estimation of multiple parameters in kinetic models Syed Murtuza Baker C Hart Poskar and Bjorn H Junker Abstract In systems biology experimentally measured parameters are not always available necessitating the use of computationally based parameter estimation. In order to rely on estimated parameters it is critical to first determine which parameters can be estimated for a given model and measurement set. This is done with parameter identifiability analysis. A kinetic model of the sucrose accumulation in the sugar cane culm tissue developed by Rohwer et al. was taken as a test case model. What differentiates this approach is the integration of an orthogonal-based local identifiability method into the unscented Kalman filter UKF rather than using the more common observability-based method which has inherent limitations. It also introduces a variable step size based on the system uncertainty of the UKF during the sensitivity calculation. This method identified 10 out of 12 parameters as identifiable. These ten parameters were estimated using the UKF which was run 97 times. Throughout the repetitions the UKF proved to be more consistent than the estimation algorithms used for comparison. 1. Introduction The focus of systems biology is to study the dynamic complex and interconnected functionality of living organisms 1 . To have a systems-level understanding of these organisms it is necessary to integrate experimental and computational techniques to form a dynamic model 1 2 . One such approach to dynamic models is the modeling of metabolic fluxes by their underlying enzymatic reaction rates. These enzymatic reaction rates or enzyme kinetics are described by a kinetic rate law. .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.