Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Tài liệu HOT
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học: "Prediction of plant promoters based on hexamers and random triplet pair analysis"
TAILIEUCHUNG - Báo cáo sinh học: "Prediction of plant promoters based on hexamers and random triplet pair analysis"
Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về sinh học được đăng trên tạp chí y học Molecular Biology cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành sinh học đề tài: Prediction of plant promoters based on hexamers and random triplet pair analysis. | Azad et al. Algorithms for Molecular Biology 2011 6 19 http content 6 1 19 AMR ALGORITHMS FOR MOLECULAR BIOLOGY RESEARCH Open Access Prediction of plant promoters based on hexamers and random triplet pair analysis A K M Azad1 Saima Shahid2 Nasimul Noman3 and Hyunju Lee1 Abstract Background With an increasing number of plant genome sequences it has become important to develop a robust computational method for detecting plant promoters. Although a wide variety of programs are currently available prediction accuracy of these still requires further improvement. The limitations of these methods can be addressed by selecting appropriate features for distinguishing promoters and non-promoters. Methods In this study we proposed two feature selection approaches based on hexamer sequences the Frequency Distribution Analyzed Feature Selection Algorithm FDAFSA and the Random Triplet Pair Feature Selecting Genetic Algorithm RTPFSGA . In FDAFSA adjacent triplet-pairs hexamer sequences were selected based on the difference in the frequency of hexamers between promoters and non-promoters. In RTPFSGA random triplet-pairs RTPs were selected by exploiting a genetic algorithm that distinguishes frequencies of non-adjacent triplet pairs between promoters and non-promoters. Then a support vector machine SVM a nonlinear machinelearning algorithm was used to classify promoters and non-promoters by combining these two feature selection approaches. We referred to this novel algorithm as PromoBot. Results Promoter sequences were collected from the PlantProm database. Non-promoter sequences were collected from plant mRNA rRNA and tRNA of PlantGDB and plant miRNA of miRBase. Then in order to validate the proposed algorithm we applied a 5-fold cross validation test. Training data sets were used to select features based on FDAFSA and RTPFSGA and these features were used to train the SVM. We achieved 89 sensitivity and 86 specificity. Conclusions We compared our PromoBot algorithm .
Chấn Phong
63
10
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo sinh học: " Research Article Levitin-Polyak Well-Posedness in Vector Quasivariational Inequality Problems with Functional Constraints"
16
95
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Stabilities of Cubic Mappings in Fuzzy Normed Spaces"
15
105
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Inequalities among Eigenvalues of Second-Order Symmetric Equations on Time Scales"
24
94
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Explicit Conditions for Stability of Nonlinear Scalar Delay Impulsive Difference Equation Bo Zheng"
17
100
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Existence and Uniqueness of Mild Solution for Fractional Integrodifferential Equations"
10
92
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Solutions of Linear Impulsive Differential Systems Bounded on the Entire Real Axis"
10
88
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Asymptotical Behaviors of Nonautonomous Discrete Kolmogorov System with Time Lags"
19
97
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Boundary Value Problems for Delay Differential Systems"
20
91
0
Báo cáo sinh học: "Research Article Monotone Iterative Technique for First-Order Nonlinear Periodic Boundary Value Problems on Time Scales"
10
99
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Symmetric Three-Term Recurrence Equations and Their Symplectic Structure"
17
103
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461861
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22625
59
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10883
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10061
446
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9517
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8277
1125
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8227
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7863
2220
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6672
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5768
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học hay
cách trình bày báo cáo
báo cáo sinh học
công trình nghiên cứu sinh học
tài liệu về sinh học
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Mass Transfer in Multiphase Systems and its Applications Part 19
40
255
1
25-04-2024
extremetech Hacking BlackBerry phần 9
31
248
0
25-04-2024
TƯƠNG QUAN GIỮA MÔ HỌC, GIẢI PHẪU VÀ HÌNH ẢNH CỦA CÁC KHỐI U PHẦN PHỤ
3
167
0
25-04-2024
Bơm máy nén quạt trong công nghiệp part 8
20
198
2
25-04-2024
Posted prices versus bargaining in markets_7
23
155
0
25-04-2024
BÀI GIẢNG VỀ - MẠCH ĐIỆN II - Chương I: Phân tích mạch trong miền thời gian
38
140
0
25-04-2024
Đề tài: Tìm hiểu một số yêu cầu đặt ra với một phòng thu âm, để đảm bảo chất lượng âm thanh trong sản phẩm đa phương tiện
8
159
1
25-04-2024
Giáo trình CẤU TRÚC DỮ LIỆU VÀ GIẢI THUẬT - Chương 1
5
125
0
25-04-2024
Khurana et al. Journal of Orthopaedic Surgery and Research 2010, 5:23
7
133
0
25-04-2024
Data Structures and Algorithms - Chapter 9: Hashing
54
113
0
25-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7863
2220
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5713
1363
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3766
1231
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5316
1136
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8277
1125
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3495
642
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10883
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3681
525
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4043
514
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4124
480
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.