TAILIEUCHUNG - Proteomic Applications in Biology Part 9

Tham khảo tài liệu 'proteomic applications in biology part 9', khoa học tự nhiên, công nghệ sinh học phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả | Plant Protein Analysis 125 scoring mechanism is employed to assess the likelihood of a correct identification. Robust protein identification requires the correct assignment of the molecular weights of at least four or five peptides. In absence of exhaustive protein or genomic databases information large expressed sequence tag EST databases have been used for protein identification. An example of a peptide mass fingerprint experiment is shown in figure 6. Fig. 6. MALDI-TOF MS spectrum of a Thlaspi protein Visioli et al. 2010 a. . The peaks marked with represent trypsin autolysis peaks that were used to internally calibrate the mass spectrum. The peaks marked with represent peaks identified as peptides produced by the trypsin digestion of a protein of interest and finally MS analysis of the eluted proteins. PMF has been used for proteome analyses from model as well as crop plants Colas et al. 2010 Glinski Weckwerth 2006 Hajduch et al. 2005 Mooney et al. 2004 Oeljeklaus et al. 2008 . For instance MALDI-TOF mass spectrometry has been used in the characterization of the Arabidopsis thaliana proteome Giavalisco et al. 2005 . The authors report the identification of 2 943 spots from 2-DE from 663 different gene products. This is a small number considering there are more than 35 000 proteins coded by the Arabidopsis genome. A survey of the proteomes of six tissues from the model legume Medicago truncatula produced 2D-PAGE reference maps from which 551 proteins were identified Watson et al. 2003 . In this case the overall successful identification rate was 55 a figure that is considered good in absence of a fully sequenced genome although the figure depended on the tissue in question. For example identification was achieved for 43 of the proteins extracted from root tissue while the figure for leaves was 76 . The difference presumably reflects the differences in the quality of the separations and the information in the databases and availability of ESTs. An investigation of

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.