TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "FusionSeq: a modular framework for finding gene fusions by analyzing paired-end RNA-sequencing data"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: FusionSeq: a modular framework for finding gene fusions by analyzing paired-end RNA-sequencing data. | Sboner et al. Genome Biology 2010 11 R104 http 2010 11 10 R104 Genome Biology METHOD Open Access FusionSeq a modular framework for finding gene fusions by analyzing paired-end RNA-sequencing data 1 f 3 3 1 2 Andrea Sboner1 Lukas Habegger Dorothee Pflueger Stephane Terry David Z Chen Joel S Rozowsky A r- I r 1 I ZV A mr 4 KI f Is i -s -s r 13 D A ỉ -s I I IV I i i 3 K I rlz c I . - - 5 rAz A m I r f I I r 3 6 h r I A Dll 1 li 3 f AShutosh K lewari Naoki Mtabayashi Benjamin J Moss Mark S Chee Francesca Demichelis Mark A RUbin Mark B Gerstein1 2 7 Abstract We have developed FusionSeq to identify fusion transcripts from paired-end RNA-sequencing. FusionSeq includes filters to remove spurious candidate fusions with artifacts such as misalignment or random pairing of transcript fragments and it ranks candidates according to several statistics. It also has a module to identify exact sequences at breakpoint junctions. FusionSeq detected known and novel fusions in a specially sequenced calibration data set including eight cancers with and without known rearrangements. Background Deep sequencing approaches applied to transcriptome profiling RNA-Seq are dramatically impacting our understanding of the extent and complexity of eukaryotic transcription 1-4 . RNA-Seq provides a more accurate measurement of expression levels of genes and more information about alternative splicing of their isoforms compared to other chip-based methods 1 4-10 . Large international consortia such as the ENCODE project 11 and the modENCODE project 12 are exploiting this technology to obtain a better picture of the transcriptome. More recently RNA-Seq was applied to the identification of fusion transcripts where mRNAs from two different genes are joined together 13-17 . Although the role of these chimeric transcripts is not fully understood some studies have shown that they might be implicated in cancer 18 19 . Also a fusion transcript may indicate an underlying genomic .

• Báo cáo khoa học
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• kiến thức y học
• nghiên cứu y học
• CÁCH TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• PHƯƠNG PHÁP TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• KĨ NĂNG TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• MẸO TRÌNH BÁY BÁO CÁO
• TRÌNH BÀY BÁO CÁO KHOA HỌC
• TRÌNH BÀY LUẬN VĂN BÁO CÁO
• Hình thức báo cáo thực tập
• Báo cáo thực tập tốt nghiệp
• Báo cáo thực tập
• Trình bày báo cáo thực tập
• Hướng dẫn trình bày báo cáo
• Hướng dẫn viết báo cáo
• Mẫu báo cáo
• Cách trình bày luận văn
• Cách trình bày khóa luận
• Thể thức của báo cáo
• trình bày luận văn
• báo cáo nông nghiệp
• báo cáo y dược
• báo cáo sinh học
• chăn nuôi lợn
• Kỹ năng trình bày báo cáo
• Kỹ năng thuyết trình
• Thiết kế slide
• Định dạng văn bản
• Nội dung trình bày báo cáo
• Thời gian thuyết trình
• Thực tập chuyên ngành
• Hướng dẫn viết tiểu luận
• Cấu trúc báo cáo
• Cách thể hiện báo cáo
• Nội dung báo cáo
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• tài liệu báo cáo nghiện cứu khoa học
• báo cáo ngành văn học
• báo cáo tiếng anh
• báo cáo khoa học
• thơ lục bát
• chăn nuôi
• báo cáo ngành kỹ thuật
• báo cáo ngành nông nghiệp
• báo cáo ngành ngoại ngữ
• báo cáo kinh tế
• báo cáo ngành tin học
• tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học
• báo cáo ngành y học
• trình bày thông tin tài sản thiếu trong báo cáo tài chính
• trình bày thông tin tài sản
• trình bày thông tin tài sản trong báo cáo tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính
• tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính doanh nghiệp
• báo cáo tài chính
• Tài liệu về trình bày đồ án
• Trình bày đồ án tốt nghiệp
• Quy định trình bày báo cáo cáo chuyên đề
• Quy định trình bày bài tập lớn
• Viện Đại học Mở Hà Nội
• mẫu báo cáo thực tập tốt nghiệp
• trình bày luận án
• cách viết báo cáo tốt nghiệp
• báo cáo tốt nghiệp
• Báo cáo phân tích ngành hàng hải
• báo cáo khoa học kinh tế
• báo cáo kỹ thuật