TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Multi-species integrative biclustering"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Multi-species integrative biclustering. | Waltman et al. Genome Biology 2010 11 R96 http 2010 11 9 R96 Genome Biology METHOD Open Access Multi-speeies integrative bielustering Defer A J Ifm 3 n 1 2t Th 3 H dr s I IC k Qr m 7 lz3t Achlox R R jfo 1 3 R h eertoc4 e ih I Roicc5 ReiTÌr- Dieherìhemer3 reter WdlUlldn lllddeous Kdci I Idiczyk Asiney R Bdte Ddniel B Kedllis Ddvid J Reiss rdtrick Eici lei Iberger Richard Bonnedu1 2 3 Abstract We describe dn dlgorithm multi-species cMonkey for the simultdneous biclustering of heterogeneous multiplespecies ddtd collections dnd dpply the dlgorithm to d group of bdcterid contdining Bacillus subtilis Bacillus anthracis dnd Listeria monocytogenes. The dlgorithm revedls evolutiondry insights into the surprisingly high degree of conser-vdtion of reguldtory modules dcross these three species dnd dllows ddtd dnd insights from well-studied orgdnisms to complement the dndlysis of reldted but less well studied orgdnisms. Background The rapidly increasing volume of genome scale data has enabled global regulatory network inference and genome-wide prediction of gene function within single organisms. In this work we exploit another advantage of the growing quantity of genomics data by comparing genome-wide datasets for closely related organisms we can add a critical evolutionary component to systems biology data analysis. Whereas several well-developed tools exist for identifying orthologous genes on the basis of sequence similarity the identification of conserved co-regulated gene groups modules is a relatively recent problem requiring development of new methods. Here we present an algorithm that performs integrative biclustering for multiple-species datasets in order to identify conserved modules and the conditions under which these modules are active. The advantages of this method are that conserved modules are more likely to be biologically significant than co-regulated gene groups lacking detectable conservation and the identification of these conserved .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.