TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: "Community transcriptomics reveals universal patterns of protein sequence conservation in natural microbial communities"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Community transcriptomics reveals universal patterns of protein sequence conservation in natural microbial communities. | Stewart et al. Genome Biology 2011 12 R26 http 2011 12 3 R26 Genome Biology RESEARCH Open Access Community transeriptomies reveals universal patterns of protein sequence conservation in natural mierobial eommunities 12 2 2 2 Frank J Stewart Adrian K Sharma Jessica A Bryant John M Eppley and Edward F DeLong Abstract Background Combined metagenomic and metatranscriptomic datasets make it possible to study the molecular evolution of diverse microbial species recovered from their native habitats. The link between gene expression level and sequence conservation was examined using shotgun pyrosequencing of microbial community DNA and RNA from diverse marine environments and from forest soil. Results Across all samples expressed genes with transcripts in the RNA sample were significantly more conserved than non-expressed gene sets relative to best matches in reference databases. This discrepancy observed for many diverse individual genomes and across entire communities coincided with a shift in amino acid usage between these gene fractions. Expressed genes trended toward GC-enriched amino acids consistent with a hypothesis of higher levels of functional constraint in this gene pool. Highly expressed genes were significantly more likely to fall within an orthologous gene set shared between closely related taxa core genes . However non-core genes when expressed above the level of detection were on average significantly more highly expressed than core genes based on transcript abundance normalized to gene abundance. Finally expressed genes showed broad similarities in function across samples being relatively enriched in genes of energy metabolism and underrepresented by genes of cell growth. Conclusions These patterns support the hypothesis predicated on studies of model organisms that gene expression level is a primary correlate of evolutionary rate across diverse microbial taxa from natural environments. Despite their complexity meta-omic datasets can .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.