TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Substantial deletion overlap among divergent Arabidopsis genomes revealed by intersection of short reads and tiling arrays"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Substantial deletion overlap among divergent Arabidopsis genomes revealed by intersection of short reads and tiling arrays. | Santuari et al. Genome Biology 2010 11 R4 http 2010 11 1 R4 w Genome Biology METHOD Open Access Substantial deletion overlap among divergent Arabidopsis genomes revealed by intersection of short reads and tiling arrays Luca Santuari 1 Sylvain Pradervand2 3 Amelia-Maria Amiguet-Vercher1 Jerome Thomas3 Eavan Dorcey1 Keith Harshman3 loannis Xenarios2 Thomas E Juenger4 and Christian S Hardtke 1 Abstract Identification of small polymorphisms from next generation sequencing short read data is relatively easy but detection of larger deletions is less straightforward. Here we analyzed four divergent Arabidopsis accessions and found that intersection of absent short read coverage with weak tiling array hybridization signal reliably flags deletions. Interestingly individual deletions were frequently observed in two or more of the accessions examined suggesting that variation in gene content partly reflects a common history of deletion events. Background Ultra-high throughput sequencing UHTS has become affordable to re-sequence genomes of model organisms such as Arabidopsis thaliana 1-5 . While identification of single nucleotide polymorphisms SNPs and small indels from UHTS short reads is relatively easy detection of structural variation such as larger deletions is less straightforward 2 3 6 7 . This is particularly true for analysis of divergent genomes such as those of Arabidop-sis strains that are not closely related to the reference accession Columbia-0 Col-0 . For instance the accuracy of short read mapping depends on the number of polymorphic sites permitted per read 8 . If it is set too high it can result in read mapping to false locations if it is set too low it can prevent mapping to the correct location. Moreover local accumulation of polymorphisms with respect to the reference genome can occur and such reads could only be correctly mapped with unrealistically relaxed settings that would interfere with overall correct annotation. Consequently the

• Báo cáo khoa học
• trình bày báo cáo
• tài liệu báo cáo khoa học
• báo cáo y học
• kiến thức y học
• nghiên cứu y học
• CÁCH TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• PHƯƠNG PHÁP TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• KĨ NĂNG TRÌNH BÀY BÁO CÁO
• MẸO TRÌNH BÁY BÁO CÁO
• TRÌNH BÀY BÁO CÁO KHOA HỌC
• TRÌNH BÀY LUẬN VĂN BÁO CÁO
• Hình thức báo cáo thực tập
• Báo cáo thực tập tốt nghiệp
• Báo cáo thực tập
• Trình bày báo cáo thực tập
• Hướng dẫn trình bày báo cáo
• Hướng dẫn viết báo cáo
• Mẫu báo cáo
• Cách trình bày luận văn
• Cách trình bày khóa luận
• Thể thức của báo cáo
• trình bày luận văn
• báo cáo nông nghiệp
• báo cáo y dược
• báo cáo sinh học
• chăn nuôi lợn
• Kỹ năng trình bày báo cáo
• Kỹ năng thuyết trình
• Thiết kế slide
• Định dạng văn bản
• Nội dung trình bày báo cáo
• Thời gian thuyết trình
• Thực tập chuyên ngành
• Hướng dẫn viết tiểu luận
• Cấu trúc báo cáo
• Cách thể hiện báo cáo
• Nội dung báo cáo
• cách trình bày báo cáo khoa học
• báo cáo khoa học sinh học
• báo cáo khoa học toán học
• tài liệu báo cáo nghiện cứu khoa học
• báo cáo ngành văn học
• báo cáo tiếng anh
• báo cáo khoa học
• thơ lục bát
• chăn nuôi
• báo cáo ngành kỹ thuật
• báo cáo ngành nông nghiệp
• báo cáo ngành ngoại ngữ
• báo cáo kinh tế
• báo cáo ngành tin học
• tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học
• báo cáo ngành y học
• trình bày thông tin tài sản thiếu trong báo cáo tài chính
• trình bày thông tin tài sản
• trình bày thông tin tài sản trong báo cáo tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính
• tài chính doanh nghiệp
• phân tích tài chính doanh nghiệp
• báo cáo tài chính
• Tài liệu về trình bày đồ án
• Trình bày đồ án tốt nghiệp
• Quy định trình bày báo cáo cáo chuyên đề
• Quy định trình bày bài tập lớn
• Viện Đại học Mở Hà Nội
• mẫu báo cáo thực tập tốt nghiệp
• trình bày luận án
• cách viết báo cáo tốt nghiệp
• báo cáo tốt nghiệp
• Báo cáo phân tích ngành hàng hải
• báo cáo khoa học kinh tế
• báo cáo kỹ thuật