TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " Basal core promoters control the equilibrium between negative cofactor 2 and preinitiation complexes in human cells"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: Basal core promoters control the equilibrium between negative cofactor 2 and preinitiation complexes in human cells. | Albert et al. Genome Biology 2010 11 R33 http 2010 11 3 R33 w Genome Biology RESEARCH Open Access Basal core promoters control the equilibrium between negative cofactor 2 and preinitiation complexes in human cells Thomas K Albert1 Korbinian Grote2 Stefan Boeing1 Michael Meisterernst1 Abstract Background The general transcription factor TFIIB and its antagonist negative cofactor 2 NC2 are hallmarks of RNA polymerase II RNAPII transcription. Both factors bind TATA box-binding protein TBP at promoters in a mutually exclusive manner. Dissociation of NC2 is thought to be followed by TFIIB association and subsequent preinitiation complex formation. TFIIB dissociates upon RNAPII promoter clearance thereby providing a specific measure for steady-state preinitiation complex levels. As yet genome-scale promoter mapping of human TFIIB has not been reported. It thus remains elusive how human core promoters contribute to preinitiation complex formation in vivo. Results We compare target genes of TFIIB and NC2 in human B cells and analyze associated core promoter architectures. TFIIB occupancy is positively correlated with gene expression with the vast majority of promoters being GC-rich and lacking defined core promoter elements. TATA elements but not the previously in vitro defined TFIIB recognition elements are enriched in some 4 to 5 of the genes. NC2 binds to a highly related target gene set. Nonetheless subpopulations show strong variations in factor ratios whereas high TFIIB NC2 ratios select for promoters with focused start sites and conserved core elements high NC2 TFIIB ratios correlate to multiple startsite promoters lacking defined core elements. Conclusions TFIIB and NC2 are global players that occupy active genes. Preinitiation complex formation is independent of core elements at the majority of genes. TATA and TATA-like elements dictate TFIIB occupancy at a subset of genes. Biochemical data support a model in which preinitiation complex but not .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.