TAILIEUCHUNG - Báo cáo y học: " COMIT: identification of noncoding motifs under selection in coding sequence"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về y học được đăng trên tạp chí y học Wertheim cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành y đề tài: COMIT: identification of noncoding motifs under selection in coding sequence. | Open Access Method COMIT identification of noncoding motifs under selection in coding sequences Deniz Kural Yang Ding Jiantao Wu Alicia M Korpi and Jeffrey H Chuang Address Department of Biology Boston College 140 Commonwealth Avenue Chestnut Hill MA 02467 USA. Correspondence Jeffrey H Chuang. Email chuangj@ Published 20 November 2009 Genome Biology 2009 10 Rl33 doi gb-2009-l0-ll-rl 33 The electronic version of this article is the complete one and can be found online at http 2009 l0 ll Rl33 Received l June 2009 Revised 18 September 2009 Accepted 20 November 2009 2009 Kural et al. licensee BioMed Central Ltd. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract Coding nucleotide sequences contain myriad functions independent of their encoded protein sequences. We present the COMIT algorithm to detect functional noncoding motifs in coding regions using sequence conservation explicitly separating nucleotide from amino acid effects. COMIT concurs with diverse experimental datasets including splicing enhancers silencers replication motifs and microRNA targets and predicts many novel functional motifs. Intriguingly COMIT scores are well-correlated to scores uncalibrated for amino acids suggesting that nucleotide motifs often override peptide-level constraints. Background Over the past few years coding nucleotide sequences have been shown to contain a myriad of functions independent of their encoded protein sequences 1 . Synonymous sites sites in coding sequence that can be changed without altering the encoded amino acid sequence that influence RNA localization 2 translation efficacy 3 mRNA splicing 4 mRNA stability 5 accessibility to the translation machinery 6 or even the structure of the folded protein 7 have been found.

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.