TAILIEUCHUNG - Wide Spectra of Quality Control Part 4

Tham khảo tài liệu 'wide spectra of quality control part 4', kỹ thuật - công nghệ, cơ khí - chế tạo máy phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả | 80 Wide Spectra of Quality Control often difficult and dependent on single favourable unpredictable conditions. Thus if anything goes wrong during sequencing the loss may be irreversible. The second aspect is that samples must not be contaminated by other samples before and after sequencing. If contamination happens it might not be detectable at all with desastrous consequences. This aspect must be integrated in process flows of sequencing facilities for example by using tagging techniques applied on each library prior to sequencing to identify immediately eventual contamination. BLAST procedures against other processed project samples or libraries must be a second manadatory strategy. 3. Quality management during molecular analyses For phylogenomic data the presented figure 4 illustrates only a rough scheme or framework of analysis. Depending on applied techniques and the choice of different software packages an adaptation is needed. Detailed descriptions of the working process to analyse rRNA and phylogenomic data with an emphasis on data quality are given in von Reumont et al. 2009 von Reumont 2010 and Meusemann et al. 2010 . 1 Sequences from different sources are processed in software pipelines quality checked and controlled. It is problematic that normally electropherograms are not available for published single sequences selected from public databases i . Therefore sequence errors cannot be discovered in these data. ii EST sequences are normally stored in the TRACE archive in NCBI including the trace files. These represent the raw data and are in general not quality checked. iii NGS raw data is stored in the Short Read Archive SRA which accounts for the difference of sequences from next generation sequencing to the conventional EST sequences. 2 Respectively for the phylogenomic data the prediction of putative ortholog genes is eminent important. This step is computationally intensive and different approaches can be used see paragraph . 3 Processed sequence

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TAILIEUCHUNG - Chia sẻ tài liệu không giới hạn
Địa chỉ : 444 Hoang Hoa Tham, Hanoi, Viet Nam
Website : tailieuchung.com
Email : tailieuchung20@gmail.com
Tailieuchung.com là thư viện tài liệu trực tuyến, nơi chia sẽ trao đổi hàng triệu tài liệu như luận văn đồ án, sách, giáo trình, đề thi.
Chúng tôi không chịu trách nhiệm liên quan đến các vấn đề bản quyền nội dung tài liệu được thành viên tự nguyện đăng tải lên, nếu phát hiện thấy tài liệu xấu hoặc tài liệu có bản quyền xin hãy email cho chúng tôi.
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.